Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAX9P55771 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PAX9P55771 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAX9P55771 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAX9P55771 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAX9P55771 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAX9P55771 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAX9P55771 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAX9P55771 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAX9P55771 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAX9P55771 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAX9P55771 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAX9P55771 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAX9P55771 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAX9P55771 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAX9P55771 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAX9P55771 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAX9P55771 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAX9P55771 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAX9P55771 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAX9P55771 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAX9P55771 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAX9P55771 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAX9P55771 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAX9P55771 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAX9P55771 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAX9P55771 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAX9P55771 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAX9P55771 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAX9P55771 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAX9P55771 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PAX9P55771 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAX9P55771 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAX9P55771 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAX9P55771 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAX9P55771 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PAX9P55771 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAX9P55771 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAX9P55771 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAX9P55771 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAX9P55771 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAX9P55771 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PAX9P55771 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PAX9P55771 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PAX9P55771 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAX9P55771 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAX9P55771 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAX9P55771 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAX9P55771 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAX9P55771 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAX9P55771 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAX9P55771 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAX9P55771 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAX9P55771 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAX9P55771 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAX9P55771 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAX9P55771 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAX9P55771 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAX9P55771 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAX9P55771 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAX9P55771 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAX9P55771 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAX9P55771 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PAX9P55771 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PAX9P55771 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAX9P55771 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAX9P55771 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAX9P55771 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAX9P55771 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAX9P55771 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAX9P55771 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAX9P55771 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAX9P55771 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAX9P55771 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAX9P55771 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAX9P55771 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAX9P55771 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAX9P55771 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAX9P55771 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAX9P55771 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAX9P55771 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAX9P55771 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAX9P55771 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAX9P55771 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAX9P55771 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAX9P55771 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAX9P55771 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAX9P55771 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAX9P55771 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PAX9P55771 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAX9P55771 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAX9P55771 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAX9P55771 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAX9P55771 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAX9P55771 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAX9P55771 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAX9P55771 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAX9P55771 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PAX9P55771 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAX9P55771 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms