Protein–RNA interactions for Protein: P55273

CDKN2D, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2DP55273 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKN2DP55273 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKN2DP55273 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKN2DP55273 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKN2DP55273 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKN2DP55273 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKN2DP55273 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKN2DP55273 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKN2DP55273 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKN2DP55273 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKN2DP55273 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKN2DP55273 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKN2DP55273 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKN2DP55273 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKN2DP55273 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CDKN2DP55273 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CDKN2DP55273 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKN2DP55273 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKN2DP55273 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKN2DP55273 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKN2DP55273 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKN2DP55273 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKN2DP55273 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKN2DP55273 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKN2DP55273 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKN2DP55273 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN2DP55273 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN2DP55273 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN2DP55273 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN2DP55273 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN2DP55273 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN2DP55273 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN2DP55273 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN2DP55273 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN2DP55273 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN2DP55273 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN2DP55273 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN2DP55273 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN2DP55273 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN2DP55273 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN2DP55273 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKN2DP55273 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKN2DP55273 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKN2DP55273 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKN2DP55273 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKN2DP55273 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKN2DP55273 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKN2DP55273 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKN2DP55273 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKN2DP55273 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKN2DP55273 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKN2DP55273 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKN2DP55273 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKN2DP55273 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKN2DP55273 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKN2DP55273 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKN2DP55273 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKN2DP55273 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKN2DP55273 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKN2DP55273 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKN2DP55273 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKN2DP55273 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKN2DP55273 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKN2DP55273 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKN2DP55273 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKN2DP55273 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKN2DP55273 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKN2DP55273 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKN2DP55273 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKN2DP55273 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKN2DP55273 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKN2DP55273 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDKN2DP55273 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDKN2DP55273 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKN2DP55273 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKN2DP55273 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKN2DP55273 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKN2DP55273 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKN2DP55273 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKN2DP55273 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKN2DP55273 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKN2DP55273 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN2DP55273 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN2DP55273 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN2DP55273 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN2DP55273 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN2DP55273 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN2DP55273 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN2DP55273 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN2DP55273 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN2DP55273 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN2DP55273 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN2DP55273 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN2DP55273 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN2DP55273 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN2DP55273 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN2DP55273 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN2DP55273 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN2DP55273 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN2DP55273 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms