Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HADHBP55084 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HADHBP55084 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HADHBP55084 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HADHBP55084 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HADHBP55084 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HADHBP55084 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HADHBP55084 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HADHBP55084 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HADHBP55084 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HADHBP55084 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HADHBP55084 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HADHBP55084 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HADHBP55084 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HADHBP55084 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HADHBP55084 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HADHBP55084 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HADHBP55084 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HADHBP55084 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HADHBP55084 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HADHBP55084 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HADHBP55084 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HADHBP55084 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HADHBP55084 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HADHBP55084 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HADHBP55084 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HADHBP55084 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HADHBP55084 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HADHBP55084 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HADHBP55084 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HADHBP55084 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HADHBP55084 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HADHBP55084 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HADHBP55084 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HADHBP55084 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HADHBP55084 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HADHBP55084 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HADHBP55084 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HADHBP55084 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HADHBP55084 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HADHBP55084 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HADHBP55084 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HADHBP55084 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HADHBP55084 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HADHBP55084 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HADHBP55084 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HADHBP55084 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HADHBP55084 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HADHBP55084 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HADHBP55084 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HADHBP55084 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HADHBP55084 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HADHBP55084 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HADHBP55084 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HADHBP55084 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HADHBP55084 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HADHBP55084 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HADHBP55084 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HADHBP55084 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HADHBP55084 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HADHBP55084 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HADHBP55084 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HADHBP55084 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HADHBP55084 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HADHBP55084 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HADHBP55084 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HADHBP55084 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HADHBP55084 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HADHBP55084 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HADHBP55084 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HADHBP55084 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HADHBP55084 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HADHBP55084 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HADHBP55084 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HADHBP55084 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HADHBP55084 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HADHBP55084 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HADHBP55084 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HADHBP55084 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HADHBP55084 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HADHBP55084 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HADHBP55084 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HADHBP55084 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HADHBP55084 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HADHBP55084 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HADHBP55084 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HADHBP55084 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HADHBP55084 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HADHBP55084 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HADHBP55084 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HADHBP55084 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HADHBP55084 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HADHBP55084 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HADHBP55084 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HADHBP55084 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HADHBP55084 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HADHBP55084 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HADHBP55084 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HADHBP55084 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HADHBP55084 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms