Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLTPP55058 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLTPP55058 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLTPP55058 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLTPP55058 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLTPP55058 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLTPP55058 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLTPP55058 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLTPP55058 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PLTPP55058 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLTPP55058 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLTPP55058 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLTPP55058 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLTPP55058 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLTPP55058 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLTPP55058 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLTPP55058 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLTPP55058 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLTPP55058 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PLTPP55058 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLTPP55058 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLTPP55058 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLTPP55058 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLTPP55058 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLTPP55058 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLTPP55058 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLTPP55058 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLTPP55058 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PLTPP55058 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PLTPP55058 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PLTPP55058 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PLTPP55058 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PLTPP55058 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PLTPP55058 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PLTPP55058 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PLTPP55058 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PLTPP55058 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PLTPP55058 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PLTPP55058 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PLTPP55058 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PLTPP55058 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PLTPP55058 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLTPP55058 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLTPP55058 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLTPP55058 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLTPP55058 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLTPP55058 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLTPP55058 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PLTPP55058 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PLTPP55058 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PLTPP55058 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PLTPP55058 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PLTPP55058 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PLTPP55058 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PLTPP55058 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLTPP55058 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLTPP55058 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLTPP55058 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLTPP55058 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLTPP55058 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLTPP55058 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLTPP55058 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLTPP55058 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLTPP55058 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLTPP55058 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLTPP55058 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLTPP55058 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLTPP55058 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLTPP55058 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLTPP55058 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLTPP55058 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLTPP55058 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLTPP55058 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLTPP55058 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PLTPP55058 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLTPP55058 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLTPP55058 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLTPP55058 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLTPP55058 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLTPP55058 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLTPP55058 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLTPP55058 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLTPP55058 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLTPP55058 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLTPP55058 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLTPP55058 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLTPP55058 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLTPP55058 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLTPP55058 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLTPP55058 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLTPP55058 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLTPP55058 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLTPP55058 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLTPP55058 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLTPP55058 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLTPP55058 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLTPP55058 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLTPP55058 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLTPP55058 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLTPP55058 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms