Protein–RNA interactions for Protein: P55036

PSMD4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD4P55036 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMD4P55036 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMD4P55036 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMD4P55036 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMD4P55036 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMD4P55036 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMD4P55036 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMD4P55036 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMD4P55036 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMD4P55036 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PSMD4P55036 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMD4P55036 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMD4P55036 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMD4P55036 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMD4P55036 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMD4P55036 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMD4P55036 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMD4P55036 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMD4P55036 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMD4P55036 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMD4P55036 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMD4P55036 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMD4P55036 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PSMD4P55036 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMD4P55036 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMD4P55036 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMD4P55036 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMD4P55036 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMD4P55036 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMD4P55036 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMD4P55036 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMD4P55036 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMD4P55036 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMD4P55036 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMD4P55036 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMD4P55036 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMD4P55036 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSMD4P55036 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PSMD4P55036 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSMD4P55036 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PSMD4P55036 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PSMD4P55036 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSMD4P55036 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PSMD4P55036 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PSMD4P55036 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMD4P55036 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMD4P55036 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMD4P55036 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMD4P55036 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMD4P55036 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMD4P55036 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMD4P55036 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMD4P55036 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMD4P55036 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMD4P55036 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMD4P55036 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMD4P55036 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMD4P55036 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMD4P55036 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMD4P55036 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMD4P55036 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMD4P55036 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMD4P55036 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMD4P55036 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMD4P55036 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMD4P55036 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMD4P55036 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMD4P55036 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMD4P55036 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMD4P55036 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMD4P55036 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMD4P55036 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMD4P55036 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMD4P55036 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMD4P55036 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMD4P55036 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMD4P55036 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMD4P55036 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMD4P55036 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMD4P55036 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMD4P55036 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMD4P55036 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMD4P55036 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMD4P55036 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMD4P55036 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMD4P55036 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMD4P55036 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMD4P55036 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMD4P55036 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMD4P55036 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMD4P55036 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMD4P55036 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMD4P55036 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMD4P55036 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMD4P55036 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMD4P55036 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMD4P55036 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMD4P55036 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMD4P55036 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMD4P55036 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms