Protein–RNA interactions for Protein: P54845

NRL, Neural retina-specific leucine zipper protein, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRLP54845 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NRLP54845 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NRLP54845 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NRLP54845 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NRLP54845 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NRLP54845 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NRLP54845 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NRLP54845 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NRLP54845 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NRLP54845 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NRLP54845 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NRLP54845 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NRLP54845 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NRLP54845 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NRLP54845 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NRLP54845 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NRLP54845 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NRLP54845 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NRLP54845 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NRLP54845 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NRLP54845 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NRLP54845 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NRLP54845 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NRLP54845 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NRLP54845 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NRLP54845 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NRLP54845 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NRLP54845 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NRLP54845 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NRLP54845 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NRLP54845 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NRLP54845 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NRLP54845 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NRLP54845 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NRLP54845 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NRLP54845 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NRLP54845 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NRLP54845 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NRLP54845 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NRLP54845 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NRLP54845 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NRLP54845 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NRLP54845 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NRLP54845 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NRLP54845 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NRLP54845 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NRLP54845 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NRLP54845 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NRLP54845 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NRLP54845 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NRLP54845 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NRLP54845 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NRLP54845 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NRLP54845 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NRLP54845 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NRLP54845 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NRLP54845 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NRLP54845 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NRLP54845 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NRLP54845 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NRLP54845 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NRLP54845 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NRLP54845 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NRLP54845 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NRLP54845 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NRLP54845 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NRLP54845 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NRLP54845 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NRLP54845 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NRLP54845 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NRLP54845 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NRLP54845 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NRLP54845 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NRLP54845 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NRLP54845 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NRLP54845 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NRLP54845 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NRLP54845 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NRLP54845 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NRLP54845 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NRLP54845 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NRLP54845 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NRLP54845 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NRLP54845 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NRLP54845 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NRLP54845 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NRLP54845 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NRLP54845 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NRLP54845 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NRLP54845 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NRLP54845 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NRLP54845 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NRLP54845 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NRLP54845 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NRLP54845 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NRLP54845 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NRLP54845 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NRLP54845 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NRLP54845 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NRLP54845 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms