Protein–RNA interactions for Protein: P54619

PRKAG1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAG1P54619 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKAG1P54619 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKAG1P54619 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKAG1P54619 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKAG1P54619 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKAG1P54619 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKAG1P54619 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKAG1P54619 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKAG1P54619 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKAG1P54619 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKAG1P54619 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKAG1P54619 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKAG1P54619 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKAG1P54619 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKAG1P54619 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKAG1P54619 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKAG1P54619 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKAG1P54619 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKAG1P54619 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKAG1P54619 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKAG1P54619 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRKAG1P54619 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRKAG1P54619 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKAG1P54619 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKAG1P54619 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKAG1P54619 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKAG1P54619 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKAG1P54619 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKAG1P54619 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKAG1P54619 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKAG1P54619 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKAG1P54619 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKAG1P54619 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKAG1P54619 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKAG1P54619 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKAG1P54619 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKAG1P54619 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKAG1P54619 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKAG1P54619 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKAG1P54619 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKAG1P54619 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKAG1P54619 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKAG1P54619 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKAG1P54619 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAG1P54619 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAG1P54619 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAG1P54619 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAG1P54619 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAG1P54619 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAG1P54619 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAG1P54619 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAG1P54619 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAG1P54619 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAG1P54619 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAG1P54619 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAG1P54619 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAG1P54619 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAG1P54619 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAG1P54619 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAG1P54619 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAG1P54619 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAG1P54619 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAG1P54619 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAG1P54619 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAG1P54619 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAG1P54619 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAG1P54619 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAG1P54619 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAG1P54619 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAG1P54619 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAG1P54619 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAG1P54619 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAG1P54619 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAG1P54619 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAG1P54619 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAG1P54619 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAG1P54619 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAG1P54619 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAG1P54619 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAG1P54619 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAG1P54619 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAG1P54619 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAG1P54619 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAG1P54619 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAG1P54619 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAG1P54619 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRKAG1P54619 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRKAG1P54619 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKAG1P54619 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKAG1P54619 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKAG1P54619 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKAG1P54619 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKAG1P54619 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKAG1P54619 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKAG1P54619 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKAG1P54619 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKAG1P54619 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAG1P54619 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAG1P54619 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAG1P54619 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms