Protein–RNA interactions for Protein: P54253

ATXN1, Ataxin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN1P54253 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATXN1P54253 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATXN1P54253 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATXN1P54253 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATXN1P54253 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATXN1P54253 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATXN1P54253 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATXN1P54253 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATXN1P54253 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ATXN1P54253 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATXN1P54253 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATXN1P54253 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATXN1P54253 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATXN1P54253 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATXN1P54253 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATXN1P54253 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATXN1P54253 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATXN1P54253 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATXN1P54253 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATXN1P54253 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATXN1P54253 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ATXN1P54253 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATXN1P54253 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATXN1P54253 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATXN1P54253 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATXN1P54253 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATXN1P54253 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATXN1P54253 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATXN1P54253 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATXN1P54253 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ATXN1P54253 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATXN1P54253 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATXN1P54253 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATXN1P54253 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATXN1P54253 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATXN1P54253 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ATXN1P54253 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATXN1P54253 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATXN1P54253 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATXN1P54253 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATXN1P54253 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATXN1P54253 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATXN1P54253 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATXN1P54253 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATXN1P54253 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATXN1P54253 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ATXN1P54253 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATXN1P54253 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATXN1P54253 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATXN1P54253 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATXN1P54253 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATXN1P54253 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ATXN1P54253 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATXN1P54253 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATXN1P54253 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATXN1P54253 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATXN1P54253 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATXN1P54253 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATXN1P54253 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATXN1P54253 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATXN1P54253 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATXN1P54253 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATXN1P54253 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ATXN1P54253 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATXN1P54253 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATXN1P54253 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATXN1P54253 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATXN1P54253 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ATXN1P54253 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATXN1P54253 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATXN1P54253 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATXN1P54253 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATXN1P54253 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATXN1P54253 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATXN1P54253 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATXN1P54253 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATXN1P54253 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATXN1P54253 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATXN1P54253 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATXN1P54253 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATXN1P54253 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATXN1P54253 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATXN1P54253 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATXN1P54253 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATXN1P54253 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATXN1P54253 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATXN1P54253 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATXN1P54253 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATXN1P54253 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATXN1P54253 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATXN1P54253 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ATXN1P54253 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATXN1P54253 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATXN1P54253 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATXN1P54253 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATXN1P54253 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ATXN1P54253 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ATXN1P54253 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATXN1P54253 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATXN1P54253 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms