Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA8P53708 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA8P53708 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA8P53708 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA8P53708 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGA8P53708 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGA8P53708 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGA8P53708 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGA8P53708 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGA8P53708 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ITGA8P53708 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA8P53708 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA8P53708 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA8P53708 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA8P53708 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA8P53708 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA8P53708 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA8P53708 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA8P53708 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA8P53708 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA8P53708 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA8P53708 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA8P53708 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA8P53708 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA8P53708 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA8P53708 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA8P53708 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA8P53708 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA8P53708 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA8P53708 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA8P53708 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA8P53708 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA8P53708 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA8P53708 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA8P53708 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA8P53708 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA8P53708 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA8P53708 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA8P53708 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA8P53708 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA8P53708 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA8P53708 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA8P53708 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA8P53708 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA8P53708 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA8P53708 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA8P53708 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA8P53708 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA8P53708 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA8P53708 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA8P53708 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA8P53708 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA8P53708 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA8P53708 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA8P53708 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA8P53708 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA8P53708 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA8P53708 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA8P53708 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA8P53708 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA8P53708 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA8P53708 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA8P53708 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
ITGA8P53708 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA8P53708 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA8P53708 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA8P53708 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA8P53708 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA8P53708 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA8P53708 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA8P53708 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA8P53708 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA8P53708 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA8P53708 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA8P53708 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA8P53708 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA8P53708 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA8P53708 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA8P53708 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA8P53708 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA8P53708 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA8P53708 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA8P53708 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA8P53708 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA8P53708 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA8P53708 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA8P53708 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA8P53708 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA8P53708 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA8P53708 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA8P53708 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA8P53708 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA8P53708 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA8P53708 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA8P53708 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA8P53708 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA8P53708 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA8P53708 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA8P53708 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA8P53708 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms