Protein–RNA interactions for Protein: P52735

VAV2, Guanine nucleotide exchange factor VAV2, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV2P52735 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VAV2P52735 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VAV2P52735 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VAV2P52735 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VAV2P52735 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VAV2P52735 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VAV2P52735 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VAV2P52735 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VAV2P52735 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VAV2P52735 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VAV2P52735 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VAV2P52735 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VAV2P52735 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VAV2P52735 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VAV2P52735 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VAV2P52735 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VAV2P52735 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VAV2P52735 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VAV2P52735 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VAV2P52735 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAV2P52735 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAV2P52735 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
VAV2P52735 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAV2P52735 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAV2P52735 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VAV2P52735 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VAV2P52735 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VAV2P52735 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VAV2P52735 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VAV2P52735 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VAV2P52735 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
VAV2P52735 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
VAV2P52735 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
VAV2P52735 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
VAV2P52735 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
VAV2P52735 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
VAV2P52735 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VAV2P52735 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VAV2P52735 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VAV2P52735 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VAV2P52735 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VAV2P52735 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VAV2P52735 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VAV2P52735 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VAV2P52735 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VAV2P52735 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAV2P52735 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAV2P52735 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAV2P52735 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAV2P52735 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAV2P52735 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAV2P52735 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAV2P52735 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAV2P52735 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VAV2P52735 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
VAV2P52735 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VAV2P52735 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VAV2P52735 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VAV2P52735 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VAV2P52735 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VAV2P52735 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VAV2P52735 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VAV2P52735 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VAV2P52735 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VAV2P52735 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VAV2P52735 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VAV2P52735 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VAV2P52735 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
VAV2P52735 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VAV2P52735 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
VAV2P52735 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VAV2P52735 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VAV2P52735 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VAV2P52735 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
VAV2P52735 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VAV2P52735 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VAV2P52735 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VAV2P52735 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VAV2P52735 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VAV2P52735 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VAV2P52735 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VAV2P52735 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VAV2P52735 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VAV2P52735 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VAV2P52735 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VAV2P52735 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VAV2P52735 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VAV2P52735 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VAV2P52735 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VAV2P52735 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VAV2P52735 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
VAV2P52735 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VAV2P52735 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VAV2P52735 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VAV2P52735 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VAV2P52735 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VAV2P52735 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VAV2P52735 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VAV2P52735 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VAV2P52735 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms