Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEK4P51957 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEK4P51957 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEK4P51957 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEK4P51957 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEK4P51957 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEK4P51957 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEK4P51957 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEK4P51957 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEK4P51957 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEK4P51957 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEK4P51957 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEK4P51957 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEK4P51957 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEK4P51957 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEK4P51957 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEK4P51957 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEK4P51957 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEK4P51957 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEK4P51957 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEK4P51957 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEK4P51957 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEK4P51957 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEK4P51957 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEK4P51957 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEK4P51957 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEK4P51957 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEK4P51957 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEK4P51957 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEK4P51957 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEK4P51957 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEK4P51957 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEK4P51957 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEK4P51957 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEK4P51957 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEK4P51957 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEK4P51957 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEK4P51957 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEK4P51957 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEK4P51957 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEK4P51957 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEK4P51957 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEK4P51957 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEK4P51957 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEK4P51957 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEK4P51957 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEK4P51957 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEK4P51957 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEK4P51957 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
NEK4P51957 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEK4P51957 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEK4P51957 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEK4P51957 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEK4P51957 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEK4P51957 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEK4P51957 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEK4P51957 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEK4P51957 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEK4P51957 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEK4P51957 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEK4P51957 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEK4P51957 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEK4P51957 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEK4P51957 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEK4P51957 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEK4P51957 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEK4P51957 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEK4P51957 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEK4P51957 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEK4P51957 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEK4P51957 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEK4P51957 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEK4P51957 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEK4P51957 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEK4P51957 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEK4P51957 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEK4P51957 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEK4P51957 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEK4P51957 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEK4P51957 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEK4P51957 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NEK4P51957 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEK4P51957 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEK4P51957 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEK4P51957 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEK4P51957 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEK4P51957 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEK4P51957 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEK4P51957 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEK4P51957 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEK4P51957 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEK4P51957 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEK4P51957 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEK4P51957 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEK4P51957 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEK4P51957 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEK4P51957 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEK4P51957 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEK4P51957 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEK4P51957 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms