Protein–RNA interactions for Protein: P50993

ATP1A2, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A2P50993 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP1A2P50993 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP1A2P50993 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP1A2P50993 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP1A2P50993 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP1A2P50993 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP1A2P50993 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP1A2P50993 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP1A2P50993 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP1A2P50993 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP1A2P50993 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP1A2P50993 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP1A2P50993 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP1A2P50993 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP1A2P50993 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP1A2P50993 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP1A2P50993 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP1A2P50993 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP1A2P50993 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP1A2P50993 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP1A2P50993 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP1A2P50993 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP1A2P50993 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP1A2P50993 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP1A2P50993 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP1A2P50993 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP1A2P50993 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP1A2P50993 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP1A2P50993 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATP1A2P50993 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATP1A2P50993 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms