Protein–RNA interactions for Protein: P50552

VASP, Vasodilator-stimulated phosphoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VASPP50552 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VASPP50552 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VASPP50552 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VASPP50552 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VASPP50552 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
VASPP50552 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VASPP50552 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VASPP50552 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VASPP50552 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VASPP50552 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VASPP50552 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VASPP50552 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VASPP50552 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VASPP50552 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VASPP50552 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VASPP50552 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VASPP50552 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VASPP50552 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VASPP50552 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VASPP50552 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VASPP50552 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VASPP50552 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
VASPP50552 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VASPP50552 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VASPP50552 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VASPP50552 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VASPP50552 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VASPP50552 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VASPP50552 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VASPP50552 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VASPP50552 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VASPP50552 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VASPP50552 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VASPP50552 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VASPP50552 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VASPP50552 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VASPP50552 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VASPP50552 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VASPP50552 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VASPP50552 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VASPP50552 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VASPP50552 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VASPP50552 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VASPP50552 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VASPP50552 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VASPP50552 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VASPP50552 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VASPP50552 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VASPP50552 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VASPP50552 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VASPP50552 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VASPP50552 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VASPP50552 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VASPP50552 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VASPP50552 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VASPP50552 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VASPP50552 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VASPP50552 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VASPP50552 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VASPP50552 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VASPP50552 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VASPP50552 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VASPP50552 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VASPP50552 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VASPP50552 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VASPP50552 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VASPP50552 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VASPP50552 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VASPP50552 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VASPP50552 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VASPP50552 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VASPP50552 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VASPP50552 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VASPP50552 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VASPP50552 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VASPP50552 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VASPP50552 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VASPP50552 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VASPP50552 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VASPP50552 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VASPP50552 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VASPP50552 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VASPP50552 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VASPP50552 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VASPP50552 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VASPP50552 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VASPP50552 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VASPP50552 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VASPP50552 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VASPP50552 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VASPP50552 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VASPP50552 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VASPP50552 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VASPP50552 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VASPP50552 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VASPP50552 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VASPP50552 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VASPP50552 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VASPP50552 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VASPP50552 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms