Protein–RNA interactions for Protein: P49588

AARS, Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AARSP49588 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.019e-10■■■■■ 48
AARSP49588 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.039e-10■■■■■ 48
AARSP49588 ACTN4-204ENST00000440400 3180 ntTSL 514.02□□□□□ -0.179e-10■■■■■ 48
AARSP49588 DNTTIP1-203ENST00000435014 930 ntTSL 510.36□□□□□ -0.754e-6■■■■■ 48
AARSP49588 MCM8-204ENST00000378896 3769 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.759e-10■■■■■ 48
AARSP49588 MCM8-202ENST00000378883 3574 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.799e-10■■■■■ 48
AARSP49588 MCM8-203ENST00000378886 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.799e-10■■■■■ 48
AARSP49588 MCM8-205ENST00000610722 7486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.949e-10■■■■■ 48
AARSP49588 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.279e-10■■■■■ 48
AARSP49588 DYRK1A-207ENST00000462274 1189 ntTSL 1 (best)27.71■■■□□ 2.031e-6■■■■■ 47.8
AARSP49588 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.111e-6■■■■■ 47.8
AARSP49588 DYRK1A-204ENST00000398960 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.631e-6■■■■■ 47.8
AARSP49588 DYRK1A-206ENST00000455097 338 ntTSL 1 (best)9.88□□□□□ -0.831e-6■■■■■ 47.8
AARSP49588 DYRK1A-201ENST00000338785 5498 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.21e-6■■■■■ 47.8
AARSP49588 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.491e-6■■■■■ 47.8
AARSP49588 DYRK1A-205ENST00000426672 519 ntTSL 54.19□□□□□ -1.741e-6■■■■■ 47.8
AARSP49588 DYRK1A-208ENST00000498351 224 ntTSL 1 (best)1.31□□□□□ -2.21e-6■■■■■ 47.8
AARSP49588 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.952e-6■■■■■ 47.8
AARSP49588 TAF4-207ENST00000608887 284 ntTSL 410.17□□□□□ -0.782e-6■■■■■ 47.8
AARSP49588 AKT1-212ENST00000555380 534 ntTSL 412.26□□□□□ -0.453e-7■■■■■ 47.3
AARSP49588 KDM4B-205ENST00000588337 504 ntTSL 529.2■■■□□ 2.266e-6■■■■■ 47.1
AARSP49588 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.228e-7■■■■■ 47.1
AARSP49588 YWHAE-213ENST00000576854 1374 nt24.76■■□□□ 1.552e-6■■■■■ 46.9
AARSP49588 YWHAE-204ENST00000486241 691 ntTSL 216.09■□□□□ 0.172e-6■■■■■ 46.9
AARSP49588 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.142e-6■■■■■ 46.9
AARSP49588 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.052e-6■■■■■ 46.9
AARSP49588 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.172e-6■■■■■ 46.9
AARSP49588 YWHAE-205ENST00000489287 465 ntTSL 212.17□□□□□ -0.462e-6■■■■■ 46.9
AARSP49588 YWHAE-210ENST00000573026 780 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.622e-6■■■■■ 46.9
AARSP49588 YWHAE-211ENST00000573196 739 ntTSL 211.2□□□□□ -0.622e-6■■■■■ 46.9
AARSP49588 YWHAE-207ENST00000498643 312 ntTSL 310.93□□□□□ -0.662e-6■■■■■ 46.9
AARSP49588 YWHAE-203ENST00000469398 676 ntTSL 29.66□□□□□ -0.862e-6■■■■■ 46.9
AARSP49588 EIF4G1-214ENST00000427141 730 ntTSL 513.15□□□□□ -0.34e-6■■■■■ 46.8
AARSP49588 EIF4G1-220ENST00000440448 578 ntTSL 411.99□□□□□ -0.494e-6■■■■■ 46.8
AARSP49588 EIF4G1-223ENST00000444134 558 ntTSL 511.66□□□□□ -0.544e-6■■■■■ 46.8
AARSP49588 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.368e-7■■■■■ 46.6
AARSP49588 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.532e-7■■■■■ 46.4
AARSP49588 SDF4-205ENST00000465727 2095 ntTSL 222.41■■□□□ 1.182e-7■■■■■ 46.4
AARSP49588 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.752e-7■■■■■ 46.4
AARSP49588 SDF4-203ENST00000403997 728 ntTSL 314.42□□□□□ -0.12e-7■■■■■ 46.4
AARSP49588 STAU1-208ENST00000437404 1085 ntTSL 1 (best)22.3■■□□□ 1.162e-8■■■■■ 46.4
AARSP49588 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.152e-8■■■■■ 46.4
AARSP49588 DNM1-210ENST00000625457 333 ntTSL 221.46■■□□□ 1.032e-8■■■■■ 46.4
AARSP49588 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.912e-8■■■■■ 46.4
AARSP49588 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.832e-8■■■■■ 46.4
AARSP49588 THUMPD3-AS1-209ENST00000518437 240 ntTSL 218.97■□□□□ 0.632e-8■■■■■ 46.4
AARSP49588 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.622e-8■■■■■ 46.4
AARSP49588 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.612e-8■■■■■ 46.4
AARSP49588 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.482e-8■■■■■ 46.4
AARSP49588 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.422e-8■■■■■ 46.4
AARSP49588 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.322e-8■■■■■ 46.4
AARSP49588 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.322e-8■■■■■ 46.4
AARSP49588 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.262e-8■■■■■ 46.4
AARSP49588 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.252e-8■■■■■ 46.4
AARSP49588 CMSS1-202ENST00000463526 397 ntTSL 316.62■□□□□ 0.252e-8■■■■■ 46.4
AARSP49588 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.242e-8■■■■■ 46.4
AARSP49588 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.092e-8■■■■■ 46.4
AARSP49588 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.052e-8■■■■■ 46.4
AARSP49588 DNM1-214ENST00000630850 3442 ntTSL 215.2■□□□□ 0.022e-8■■■■■ 46.4
AARSP49588 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.052e-8■■■■■ 46.4
AARSP49588 DNM1-213ENST00000628346 3835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.162e-8■■■■■ 46.4
AARSP49588 ZBTB17-210ENST00000479282 1054 ntTSL 214.03□□□□□ -0.162e-8■■■■■ 46.4
AARSP49588 PRPF8-207ENST00000573681 1044 ntTSL 213.62□□□□□ -0.232e-8■■■■■ 46.4
AARSP49588 STAU1-209ENST00000456866 643 ntTSL 512.64□□□□□ -0.392e-8■■■■■ 46.4
AARSP49588 STAU1-202ENST00000347458 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.42e-8■■■■■ 46.4
AARSP49588 STAU1-204ENST00000371792 3130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.42e-8■■■■■ 46.4
AARSP49588 STAU1-203ENST00000360426 3211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.42e-8■■■■■ 46.4
AARSP49588 THUMPD3-AS1-203ENST00000469846 670 ntTSL 312.38□□□□□ -0.432e-8■■■■■ 46.4
AARSP49588 CMSS1-208ENST00000496116 2145 ntTSL 1 (best)12.08□□□□□ -0.482e-8■■■■■ 46.4
AARSP49588 STAU1-205ENST00000371802 3154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.552e-8■■■■■ 46.4
AARSP49588 STAU1-201ENST00000340954 3334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.622e-8■■■■■ 46.4
AARSP49588 STAU1-206ENST00000371828 3411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.632e-8■■■■■ 46.4
AARSP49588 STAU1-207ENST00000371856 3684 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.642e-8■■■■■ 46.4
AARSP49588 SEC24D-201ENST00000280551 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.672e-8■■■■■ 46.4
AARSP49588 PRPF8-201ENST00000304992 7295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.712e-8■■■■■ 46.4
AARSP49588 CMSS1-201ENST00000421999 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.842e-8■■■■■ 46.4
AARSP49588 CMSS1-206ENST00000491299 881 ntTSL 59.23□□□□□ -0.932e-8■■■■■ 46.4
AARSP49588 THUMPD3-AS1-205ENST00000481221 683 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.952e-8■■■■■ 46.4
AARSP49588 SLC25A24P1-202ENST00000434803 1220 ntBASIC8.43□□□□□ -1.062e-8■■■■■ 46.4
AARSP49588 PRPF8-209ENST00000573725 749 ntTSL 57.19□□□□□ -1.262e-8■■■■■ 46.4
AARSP49588 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.452e-8■■■■■ 46.4
AARSP49588 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.462e-8■■■■■ 46.4
AARSP49588 THUMPD3-AS1-218ENST00000522525 1867 ntTSL 1 (best)5.62□□□□□ -1.512e-8■■■■■ 46.4
AARSP49588 THUMPD3-AS1-204ENST00000480904 493 ntTSL 35.49□□□□□ -1.532e-8■■■■■ 46.4
AARSP49588 SEC24D-206ENST00000505134 3915 ntTSL 25.44□□□□□ -1.542e-8■■■■■ 46.4
AARSP49588 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.552e-8■■■■■ 46.4
AARSP49588 SEC24D-210ENST00000511033 576 ntTSL 45.31□□□□□ -1.562e-8■■■■■ 46.4
AARSP49588 SEC24D-214ENST00000514561 3806 ntTSL 1 (best)5.28□□□□□ -1.562e-8■■■■■ 46.4
AARSP49588 THUMPD3-AS1-201ENST00000467069 667 ntTSL 54.67□□□□□ -1.662e-8■■■■■ 46.4
AARSP49588 THUMPD3-AS1-216ENST00000521708 549 ntTSL 34.32□□□□□ -1.722e-8■■■■■ 46.4
AARSP49588 THUMPD3-AS1-207ENST00000494680 544 ntTSL 53.98□□□□□ -1.772e-8■■■■■ 46.4
AARSP49588 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.443e-6■■■■■ 46.2
AARSP49588 GRB10-212ENST00000439044 733 ntTSL 523.85■■□□□ 1.418e-7■■■■■ 46.1
AARSP49588 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.168e-7■■■■■ 46.1
AARSP49588 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.828e-7■■■■■ 46.1
AARSP49588 CCNY-209ENST00000493157 816 ntTSL 518.51■□□□□ 0.552e-6■■■■■ 46
AARSP49588 CCNY-207ENST00000490012 793 ntTSL 316.77■□□□□ 0.282e-6■■■■■ 46
AARSP49588 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.252e-6■■■■■ 46
AARSP49588 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.12e-6■■■■■ 46
AARSP49588 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.122e-6■■■■■ 46
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