Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC11A1P49279 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC11A1P49279 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC11A1P49279 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC11A1P49279 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC11A1P49279 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC11A1P49279 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC11A1P49279 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC11A1P49279 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC11A1P49279 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC11A1P49279 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC11A1P49279 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC11A1P49279 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC11A1P49279 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC11A1P49279 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC11A1P49279 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC11A1P49279 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC11A1P49279 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC11A1P49279 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC11A1P49279 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC11A1P49279 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC11A1P49279 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC11A1P49279 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC11A1P49279 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC11A1P49279 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC11A1P49279 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC11A1P49279 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC11A1P49279 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC11A1P49279 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC11A1P49279 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC11A1P49279 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC11A1P49279 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC11A1P49279 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC11A1P49279 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC11A1P49279 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC11A1P49279 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC11A1P49279 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC11A1P49279 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC11A1P49279 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC11A1P49279 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC11A1P49279 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC11A1P49279 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC11A1P49279 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC11A1P49279 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC11A1P49279 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC11A1P49279 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC11A1P49279 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC11A1P49279 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC11A1P49279 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC11A1P49279 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC11A1P49279 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC11A1P49279 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC11A1P49279 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC11A1P49279 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC11A1P49279 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC11A1P49279 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC11A1P49279 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC11A1P49279 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC11A1P49279 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC11A1P49279 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC11A1P49279 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC11A1P49279 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC11A1P49279 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC11A1P49279 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC11A1P49279 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC11A1P49279 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC11A1P49279 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC11A1P49279 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC11A1P49279 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC11A1P49279 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC11A1P49279 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC11A1P49279 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC11A1P49279 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC11A1P49279 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC11A1P49279 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC11A1P49279 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC11A1P49279 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC11A1P49279 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC11A1P49279 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC11A1P49279 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC11A1P49279 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC11A1P49279 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC11A1P49279 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC11A1P49279 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC11A1P49279 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC11A1P49279 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC11A1P49279 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC11A1P49279 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC11A1P49279 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC11A1P49279 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC11A1P49279 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC11A1P49279 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC11A1P49279 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC11A1P49279 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC11A1P49279 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC11A1P49279 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC11A1P49279 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC11A1P49279 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC11A1P49279 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC11A1P49279 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms