Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMAN1P49257 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMAN1P49257 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMAN1P49257 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMAN1P49257 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMAN1P49257 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMAN1P49257 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMAN1P49257 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMAN1P49257 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMAN1P49257 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMAN1P49257 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LMAN1P49257 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMAN1P49257 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMAN1P49257 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMAN1P49257 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMAN1P49257 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMAN1P49257 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LMAN1P49257 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMAN1P49257 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMAN1P49257 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMAN1P49257 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMAN1P49257 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMAN1P49257 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMAN1P49257 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LMAN1P49257 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMAN1P49257 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMAN1P49257 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMAN1P49257 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMAN1P49257 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMAN1P49257 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMAN1P49257 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMAN1P49257 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMAN1P49257 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMAN1P49257 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMAN1P49257 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMAN1P49257 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMAN1P49257 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMAN1P49257 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMAN1P49257 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMAN1P49257 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMAN1P49257 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMAN1P49257 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMAN1P49257 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMAN1P49257 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMAN1P49257 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMAN1P49257 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMAN1P49257 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMAN1P49257 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMAN1P49257 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMAN1P49257 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LMAN1P49257 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMAN1P49257 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMAN1P49257 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMAN1P49257 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMAN1P49257 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LMAN1P49257 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMAN1P49257 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMAN1P49257 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMAN1P49257 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LMAN1P49257 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LMAN1P49257 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LMAN1P49257 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LMAN1P49257 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LMAN1P49257 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMAN1P49257 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms