Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRPC1P48995 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRPC1P48995 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRPC1P48995 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRPC1P48995 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRPC1P48995 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRPC1P48995 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRPC1P48995 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRPC1P48995 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRPC1P48995 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRPC1P48995 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRPC1P48995 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRPC1P48995 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRPC1P48995 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRPC1P48995 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRPC1P48995 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRPC1P48995 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRPC1P48995 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRPC1P48995 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRPC1P48995 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRPC1P48995 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRPC1P48995 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRPC1P48995 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TRPC1P48995 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRPC1P48995 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRPC1P48995 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRPC1P48995 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRPC1P48995 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRPC1P48995 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRPC1P48995 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRPC1P48995 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRPC1P48995 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRPC1P48995 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRPC1P48995 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRPC1P48995 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRPC1P48995 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRPC1P48995 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRPC1P48995 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRPC1P48995 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRPC1P48995 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRPC1P48995 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRPC1P48995 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRPC1P48995 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRPC1P48995 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRPC1P48995 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TRPC1P48995 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TRPC1P48995 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRPC1P48995 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRPC1P48995 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRPC1P48995 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRPC1P48995 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRPC1P48995 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRPC1P48995 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRPC1P48995 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRPC1P48995 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRPC1P48995 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRPC1P48995 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRPC1P48995 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRPC1P48995 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRPC1P48995 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TRPC1P48995 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRPC1P48995 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRPC1P48995 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRPC1P48995 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRPC1P48995 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRPC1P48995 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRPC1P48995 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRPC1P48995 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRPC1P48995 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRPC1P48995 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRPC1P48995 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRPC1P48995 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRPC1P48995 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRPC1P48995 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRPC1P48995 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRPC1P48995 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRPC1P48995 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRPC1P48995 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRPC1P48995 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRPC1P48995 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRPC1P48995 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRPC1P48995 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRPC1P48995 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRPC1P48995 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRPC1P48995 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRPC1P48995 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRPC1P48995 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRPC1P48995 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms