Protein–RNA interactions for Protein: P48664

SLC1A6, Excitatory amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A6P48664 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC1A6P48664 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC1A6P48664 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC1A6P48664 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC1A6P48664 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC1A6P48664 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC1A6P48664 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC1A6P48664 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC1A6P48664 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC1A6P48664 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC1A6P48664 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC1A6P48664 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC1A6P48664 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC1A6P48664 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC1A6P48664 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC1A6P48664 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC1A6P48664 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC1A6P48664 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC1A6P48664 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC1A6P48664 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC1A6P48664 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC1A6P48664 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC1A6P48664 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC1A6P48664 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC1A6P48664 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC1A6P48664 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC1A6P48664 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC1A6P48664 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC1A6P48664 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC1A6P48664 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC1A6P48664 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC1A6P48664 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC1A6P48664 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC1A6P48664 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC1A6P48664 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC1A6P48664 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC1A6P48664 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC1A6P48664 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC1A6P48664 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC1A6P48664 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC1A6P48664 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC1A6P48664 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC1A6P48664 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC1A6P48664 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC1A6P48664 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC1A6P48664 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC1A6P48664 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC1A6P48664 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC1A6P48664 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC1A6P48664 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC1A6P48664 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC1A6P48664 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC1A6P48664 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC1A6P48664 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC1A6P48664 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC1A6P48664 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC1A6P48664 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC1A6P48664 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC1A6P48664 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC1A6P48664 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC1A6P48664 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC1A6P48664 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC1A6P48664 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC1A6P48664 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC1A6P48664 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC1A6P48664 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC1A6P48664 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC1A6P48664 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC1A6P48664 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC1A6P48664 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC1A6P48664 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC1A6P48664 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC1A6P48664 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC1A6P48664 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC1A6P48664 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC1A6P48664 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC1A6P48664 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC1A6P48664 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC1A6P48664 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC1A6P48664 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC1A6P48664 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC1A6P48664 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC1A6P48664 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC1A6P48664 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC1A6P48664 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SLC1A6P48664 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC1A6P48664 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC1A6P48664 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC1A6P48664 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC1A6P48664 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC1A6P48664 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC1A6P48664 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC1A6P48664 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC1A6P48664 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC1A6P48664 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC1A6P48664 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC1A6P48664 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC1A6P48664 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC1A6P48664 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC1A6P48664 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms