Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARCN1P48444 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARCN1P48444 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARCN1P48444 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARCN1P48444 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARCN1P48444 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARCN1P48444 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARCN1P48444 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARCN1P48444 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARCN1P48444 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARCN1P48444 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARCN1P48444 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARCN1P48444 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARCN1P48444 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARCN1P48444 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARCN1P48444 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARCN1P48444 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARCN1P48444 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARCN1P48444 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARCN1P48444 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARCN1P48444 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARCN1P48444 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARCN1P48444 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARCN1P48444 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARCN1P48444 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARCN1P48444 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARCN1P48444 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARCN1P48444 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARCN1P48444 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARCN1P48444 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ARCN1P48444 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARCN1P48444 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARCN1P48444 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARCN1P48444 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARCN1P48444 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARCN1P48444 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARCN1P48444 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ARCN1P48444 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ARCN1P48444 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARCN1P48444 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARCN1P48444 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARCN1P48444 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARCN1P48444 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARCN1P48444 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARCN1P48444 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARCN1P48444 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARCN1P48444 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARCN1P48444 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARCN1P48444 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ARCN1P48444 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARCN1P48444 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARCN1P48444 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARCN1P48444 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARCN1P48444 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARCN1P48444 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARCN1P48444 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARCN1P48444 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARCN1P48444 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ARCN1P48444 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARCN1P48444 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ARCN1P48444 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARCN1P48444 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARCN1P48444 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ARCN1P48444 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARCN1P48444 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ARCN1P48444 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARCN1P48444 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARCN1P48444 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARCN1P48444 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARCN1P48444 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARCN1P48444 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARCN1P48444 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARCN1P48444 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ARCN1P48444 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARCN1P48444 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ARCN1P48444 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARCN1P48444 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARCN1P48444 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARCN1P48444 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARCN1P48444 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARCN1P48444 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARCN1P48444 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARCN1P48444 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARCN1P48444 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARCN1P48444 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARCN1P48444 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARCN1P48444 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARCN1P48444 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARCN1P48444 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARCN1P48444 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARCN1P48444 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARCN1P48444 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARCN1P48444 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARCN1P48444 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARCN1P48444 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARCN1P48444 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARCN1P48444 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ARCN1P48444 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARCN1P48444 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARCN1P48444 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms