Protein–RNA interactions for Protein: P43355

MAGEA1, Melanoma-associated antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA1P43355 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MAGEA1P43355 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MAGEA1P43355 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MAGEA1P43355 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MAGEA1P43355 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MAGEA1P43355 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MAGEA1P43355 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MAGEA1P43355 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MAGEA1P43355 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MAGEA1P43355 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MAGEA1P43355 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MAGEA1P43355 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MAGEA1P43355 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MAGEA1P43355 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MAGEA1P43355 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MAGEA1P43355 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MAGEA1P43355 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MAGEA1P43355 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MAGEA1P43355 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MAGEA1P43355 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MAGEA1P43355 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MAGEA1P43355 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MAGEA1P43355 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MAGEA1P43355 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAGEA1P43355 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAGEA1P43355 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAGEA1P43355 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAGEA1P43355 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAGEA1P43355 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAGEA1P43355 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAGEA1P43355 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAGEA1P43355 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAGEA1P43355 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAGEA1P43355 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAGEA1P43355 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAGEA1P43355 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAGEA1P43355 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MAGEA1P43355 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAGEA1P43355 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAGEA1P43355 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAGEA1P43355 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAGEA1P43355 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAGEA1P43355 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAGEA1P43355 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAGEA1P43355 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAGEA1P43355 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAGEA1P43355 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAGEA1P43355 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MAGEA1P43355 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MAGEA1P43355 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MAGEA1P43355 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MAGEA1P43355 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MAGEA1P43355 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MAGEA1P43355 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MAGEA1P43355 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MAGEA1P43355 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MAGEA1P43355 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MAGEA1P43355 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MAGEA1P43355 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAGEA1P43355 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAGEA1P43355 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAGEA1P43355 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAGEA1P43355 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MAGEA1P43355 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MAGEA1P43355 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MAGEA1P43355 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MAGEA1P43355 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MAGEA1P43355 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MAGEA1P43355 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MAGEA1P43355 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MAGEA1P43355 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MAGEA1P43355 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MAGEA1P43355 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MAGEA1P43355 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MAGEA1P43355 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MAGEA1P43355 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MAGEA1P43355 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MAGEA1P43355 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MAGEA1P43355 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MAGEA1P43355 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MAGEA1P43355 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MAGEA1P43355 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAGEA1P43355 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAGEA1P43355 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAGEA1P43355 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAGEA1P43355 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAGEA1P43355 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAGEA1P43355 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAGEA1P43355 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAGEA1P43355 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MAGEA1P43355 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MAGEA1P43355 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAGEA1P43355 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAGEA1P43355 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAGEA1P43355 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MAGEA1P43355 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MAGEA1P43355 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MAGEA1P43355 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MAGEA1P43355 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MAGEA1P43355 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1018.3 ms