Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3CBP42338 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3CBP42338 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3CBP42338 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3CBP42338 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3CBP42338 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3CBP42338 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3CBP42338 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3CBP42338 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3CBP42338 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3CBP42338 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3CBP42338 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3CBP42338 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3CBP42338 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3CBP42338 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3CBP42338 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3CBP42338 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3CBP42338 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3CBP42338 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3CBP42338 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3CBP42338 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3CBP42338 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3CBP42338 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3CBP42338 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3CBP42338 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3CBP42338 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3CBP42338 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3CBP42338 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3CBP42338 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3CBP42338 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3CBP42338 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3CBP42338 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3CBP42338 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3CBP42338 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3CBP42338 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3CBP42338 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3CBP42338 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3CBP42338 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3CBP42338 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3CBP42338 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3CBP42338 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3CBP42338 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3CBP42338 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3CBP42338 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3CBP42338 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3CBP42338 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3CBP42338 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3CBP42338 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3CBP42338 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3CBP42338 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3CBP42338 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3CBP42338 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3CBP42338 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3CBP42338 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PIK3CBP42338 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3CBP42338 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3CBP42338 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3CBP42338 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3CBP42338 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3CBP42338 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3CBP42338 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3CBP42338 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3CBP42338 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3CBP42338 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3CBP42338 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3CBP42338 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3CBP42338 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3CBP42338 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3CBP42338 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3CBP42338 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3CBP42338 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3CBP42338 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3CBP42338 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3CBP42338 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3CBP42338 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3CBP42338 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3CBP42338 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3CBP42338 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3CBP42338 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3CBP42338 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3CBP42338 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIK3CBP42338 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIK3CBP42338 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIK3CBP42338 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIK3CBP42338 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIK3CBP42338 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIK3CBP42338 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIK3CBP42338 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIK3CBP42338 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIK3CBP42338 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIK3CBP42338 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIK3CBP42338 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIK3CBP42338 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIK3CBP42338 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIK3CBP42338 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIK3CBP42338 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIK3CBP42338 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIK3CBP42338 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PIK3CBP42338 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIK3CBP42338 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms