Protein–RNA interactions for Protein: P42126

ECI1, Enoyl-CoA delta isomerase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECI1P42126 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ECI1P42126 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ECI1P42126 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ECI1P42126 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ECI1P42126 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ECI1P42126 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ECI1P42126 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ECI1P42126 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ECI1P42126 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ECI1P42126 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ECI1P42126 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ECI1P42126 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ECI1P42126 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ECI1P42126 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ECI1P42126 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ECI1P42126 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ECI1P42126 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ECI1P42126 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ECI1P42126 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ECI1P42126 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ECI1P42126 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ECI1P42126 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ECI1P42126 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ECI1P42126 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ECI1P42126 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ECI1P42126 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ECI1P42126 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ECI1P42126 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ECI1P42126 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ECI1P42126 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ECI1P42126 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ECI1P42126 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ECI1P42126 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ECI1P42126 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ECI1P42126 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ECI1P42126 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ECI1P42126 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ECI1P42126 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ECI1P42126 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ECI1P42126 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ECI1P42126 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ECI1P42126 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ECI1P42126 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ECI1P42126 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ECI1P42126 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ECI1P42126 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ECI1P42126 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ECI1P42126 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ECI1P42126 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ECI1P42126 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ECI1P42126 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ECI1P42126 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ECI1P42126 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ECI1P42126 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ECI1P42126 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ECI1P42126 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ECI1P42126 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ECI1P42126 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ECI1P42126 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ECI1P42126 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ECI1P42126 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ECI1P42126 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ECI1P42126 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ECI1P42126 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ECI1P42126 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ECI1P42126 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ECI1P42126 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ECI1P42126 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ECI1P42126 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ECI1P42126 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ECI1P42126 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ECI1P42126 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ECI1P42126 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ECI1P42126 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ECI1P42126 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ECI1P42126 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ECI1P42126 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ECI1P42126 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ECI1P42126 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ECI1P42126 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ECI1P42126 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ECI1P42126 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ECI1P42126 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ECI1P42126 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ECI1P42126 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ECI1P42126 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ECI1P42126 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ECI1P42126 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ECI1P42126 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ECI1P42126 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ECI1P42126 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ECI1P42126 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ECI1P42126 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ECI1P42126 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ECI1P42126 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ECI1P42126 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ECI1P42126 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ECI1P42126 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ECI1P42126 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ECI1P42126 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms