Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARL1P40616 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARL1P40616 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARL1P40616 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARL1P40616 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARL1P40616 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ARL1P40616 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARL1P40616 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARL1P40616 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARL1P40616 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ARL1P40616 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARL1P40616 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARL1P40616 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARL1P40616 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARL1P40616 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARL1P40616 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARL1P40616 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARL1P40616 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARL1P40616 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ARL1P40616 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARL1P40616 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARL1P40616 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARL1P40616 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARL1P40616 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARL1P40616 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARL1P40616 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARL1P40616 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARL1P40616 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARL1P40616 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARL1P40616 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARL1P40616 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARL1P40616 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARL1P40616 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARL1P40616 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARL1P40616 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARL1P40616 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARL1P40616 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARL1P40616 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARL1P40616 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARL1P40616 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARL1P40616 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARL1P40616 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ARL1P40616 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARL1P40616 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARL1P40616 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ARL1P40616 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARL1P40616 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARL1P40616 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARL1P40616 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ARL1P40616 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARL1P40616 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARL1P40616 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARL1P40616 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARL1P40616 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARL1P40616 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ARL1P40616 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARL1P40616 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARL1P40616 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARL1P40616 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARL1P40616 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARL1P40616 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARL1P40616 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARL1P40616 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARL1P40616 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARL1P40616 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARL1P40616 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARL1P40616 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARL1P40616 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARL1P40616 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARL1P40616 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARL1P40616 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARL1P40616 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARL1P40616 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARL1P40616 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARL1P40616 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARL1P40616 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARL1P40616 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARL1P40616 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARL1P40616 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARL1P40616 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARL1P40616 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ARL1P40616 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARL1P40616 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARL1P40616 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARL1P40616 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARL1P40616 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARL1P40616 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARL1P40616 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ARL1P40616 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARL1P40616 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARL1P40616 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARL1P40616 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARL1P40616 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARL1P40616 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARL1P40616 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARL1P40616 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARL1P40616 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARL1P40616 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARL1P40616 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARL1P40616 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms