Protein–RNA interactions for Protein: P40199

CEACAM6, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM6P40199 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CEACAM6P40199 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CEACAM6P40199 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CEACAM6P40199 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CEACAM6P40199 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CEACAM6P40199 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CEACAM6P40199 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CEACAM6P40199 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CEACAM6P40199 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CEACAM6P40199 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CEACAM6P40199 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CEACAM6P40199 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CEACAM6P40199 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CEACAM6P40199 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CEACAM6P40199 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CEACAM6P40199 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CEACAM6P40199 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CEACAM6P40199 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CEACAM6P40199 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CEACAM6P40199 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CEACAM6P40199 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CEACAM6P40199 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CEACAM6P40199 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CEACAM6P40199 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CEACAM6P40199 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CEACAM6P40199 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CEACAM6P40199 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CEACAM6P40199 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CEACAM6P40199 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CEACAM6P40199 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CEACAM6P40199 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEACAM6P40199 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEACAM6P40199 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEACAM6P40199 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEACAM6P40199 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEACAM6P40199 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEACAM6P40199 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEACAM6P40199 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEACAM6P40199 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEACAM6P40199 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEACAM6P40199 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEACAM6P40199 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEACAM6P40199 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEACAM6P40199 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEACAM6P40199 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CEACAM6P40199 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CEACAM6P40199 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CEACAM6P40199 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CEACAM6P40199 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CEACAM6P40199 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CEACAM6P40199 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CEACAM6P40199 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CEACAM6P40199 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CEACAM6P40199 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CEACAM6P40199 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CEACAM6P40199 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CEACAM6P40199 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CEACAM6P40199 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CEACAM6P40199 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CEACAM6P40199 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CEACAM6P40199 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CEACAM6P40199 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CEACAM6P40199 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CEACAM6P40199 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CEACAM6P40199 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CEACAM6P40199 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CEACAM6P40199 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CEACAM6P40199 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CEACAM6P40199 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CEACAM6P40199 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CEACAM6P40199 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CEACAM6P40199 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CEACAM6P40199 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CEACAM6P40199 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CEACAM6P40199 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CEACAM6P40199 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CEACAM6P40199 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEACAM6P40199 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEACAM6P40199 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEACAM6P40199 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEACAM6P40199 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEACAM6P40199 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEACAM6P40199 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEACAM6P40199 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEACAM6P40199 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEACAM6P40199 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEACAM6P40199 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEACAM6P40199 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEACAM6P40199 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CEACAM6P40199 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CEACAM6P40199 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CEACAM6P40199 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CEACAM6P40199 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CEACAM6P40199 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CEACAM6P40199 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CEACAM6P40199 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CEACAM6P40199 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CEACAM6P40199 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CEACAM6P40199 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CEACAM6P40199 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms