Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXD13P35453 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXD13P35453 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXD13P35453 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXD13P35453 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXD13P35453 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXD13P35453 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXD13P35453 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXD13P35453 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXD13P35453 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXD13P35453 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXD13P35453 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXD13P35453 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXD13P35453 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXD13P35453 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXD13P35453 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXD13P35453 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXD13P35453 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXD13P35453 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXD13P35453 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXD13P35453 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXD13P35453 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXD13P35453 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXD13P35453 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXD13P35453 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXD13P35453 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXD13P35453 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXD13P35453 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXD13P35453 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXD13P35453 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXD13P35453 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXD13P35453 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXD13P35453 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXD13P35453 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXD13P35453 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXD13P35453 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXD13P35453 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXD13P35453 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXD13P35453 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXD13P35453 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXD13P35453 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXD13P35453 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXD13P35453 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXD13P35453 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXD13P35453 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXD13P35453 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXD13P35453 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXD13P35453 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXD13P35453 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXD13P35453 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXD13P35453 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXD13P35453 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXD13P35453 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXD13P35453 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXD13P35453 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXD13P35453 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXD13P35453 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXD13P35453 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXD13P35453 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXD13P35453 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXD13P35453 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXD13P35453 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXD13P35453 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXD13P35453 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXD13P35453 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXD13P35453 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HOXD13P35453 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXD13P35453 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXD13P35453 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXD13P35453 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXD13P35453 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXD13P35453 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXD13P35453 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXD13P35453 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXD13P35453 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXD13P35453 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXD13P35453 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXD13P35453 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXD13P35453 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXD13P35453 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXD13P35453 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXD13P35453 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXD13P35453 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXD13P35453 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXD13P35453 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXD13P35453 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXD13P35453 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXD13P35453 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXD13P35453 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXD13P35453 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXD13P35453 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXD13P35453 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXD13P35453 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXD13P35453 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXD13P35453 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXD13P35453 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXD13P35453 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXD13P35453 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXD13P35453 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXD13P35453 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms