Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GBP1P32455 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GBP1P32455 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GBP1P32455 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GBP1P32455 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GBP1P32455 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GBP1P32455 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GBP1P32455 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GBP1P32455 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GBP1P32455 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GBP1P32455 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GBP1P32455 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GBP1P32455 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GBP1P32455 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GBP1P32455 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GBP1P32455 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GBP1P32455 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GBP1P32455 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GBP1P32455 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GBP1P32455 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GBP1P32455 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GBP1P32455 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GBP1P32455 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GBP1P32455 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GBP1P32455 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GBP1P32455 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GBP1P32455 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GBP1P32455 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GBP1P32455 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GBP1P32455 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GBP1P32455 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBP1P32455 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBP1P32455 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GBP1P32455 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBP1P32455 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBP1P32455 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBP1P32455 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GBP1P32455 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBP1P32455 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBP1P32455 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBP1P32455 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBP1P32455 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBP1P32455 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBP1P32455 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GBP1P32455 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GBP1P32455 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GBP1P32455 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GBP1P32455 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GBP1P32455 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GBP1P32455 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GBP1P32455 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GBP1P32455 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GBP1P32455 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GBP1P32455 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GBP1P32455 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GBP1P32455 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GBP1P32455 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GBP1P32455 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GBP1P32455 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GBP1P32455 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GBP1P32455 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GBP1P32455 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GBP1P32455 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GBP1P32455 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GBP1P32455 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GBP1P32455 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GBP1P32455 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GBP1P32455 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GBP1P32455 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GBP1P32455 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GBP1P32455 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GBP1P32455 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GBP1P32455 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GBP1P32455 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GBP1P32455 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GBP1P32455 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GBP1P32455 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GBP1P32455 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GBP1P32455 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GBP1P32455 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GBP1P32455 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GBP1P32455 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GBP1P32455 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GBP1P32455 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GBP1P32455 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GBP1P32455 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GBP1P32455 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GBP1P32455 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GBP1P32455 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GBP1P32455 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GBP1P32455 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GBP1P32455 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GBP1P32455 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GBP1P32455 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GBP1P32455 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GBP1P32455 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GBP1P32455 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GBP1P32455 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GBP1P32455 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GBP1P32455 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms