Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXC8P31273 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXC8P31273 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXC8P31273 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXC8P31273 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXC8P31273 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXC8P31273 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXC8P31273 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXC8P31273 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXC8P31273 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXC8P31273 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HOXC8P31273 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HOXC8P31273 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXC8P31273 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXC8P31273 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXC8P31273 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXC8P31273 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXC8P31273 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXC8P31273 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXC8P31273 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXC8P31273 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXC8P31273 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXC8P31273 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXC8P31273 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXC8P31273 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXC8P31273 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXC8P31273 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXC8P31273 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXC8P31273 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXC8P31273 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXC8P31273 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXC8P31273 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXC8P31273 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXC8P31273 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXC8P31273 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXC8P31273 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXC8P31273 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXC8P31273 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXC8P31273 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXC8P31273 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXC8P31273 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXC8P31273 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXC8P31273 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXC8P31273 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXC8P31273 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXC8P31273 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXC8P31273 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXC8P31273 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXC8P31273 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXC8P31273 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXC8P31273 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXC8P31273 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXC8P31273 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXC8P31273 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXC8P31273 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXC8P31273 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXC8P31273 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXC8P31273 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXC8P31273 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXC8P31273 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXC8P31273 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXC8P31273 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXC8P31273 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXC8P31273 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXC8P31273 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HOXC8P31273 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HOXC8P31273 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HOXC8P31273 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HOXC8P31273 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXC8P31273 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXC8P31273 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXC8P31273 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXC8P31273 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXC8P31273 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXC8P31273 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXC8P31273 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXC8P31273 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXC8P31273 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXC8P31273 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXC8P31273 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXC8P31273 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXC8P31273 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXC8P31273 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXC8P31273 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXC8P31273 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXC8P31273 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXC8P31273 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXC8P31273 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXC8P31273 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXC8P31273 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXC8P31273 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXC8P31273 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXC8P31273 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXC8P31273 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXC8P31273 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXC8P31273 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXC8P31273 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXC8P31273 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXC8P31273 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXC8P31273 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms