Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RBL1P28749 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBL1P28749 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBL1P28749 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBL1P28749 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBL1P28749 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBL1P28749 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBL1P28749 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBL1P28749 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBL1P28749 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBL1P28749 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBL1P28749 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBL1P28749 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBL1P28749 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBL1P28749 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBL1P28749 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBL1P28749 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBL1P28749 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RBL1P28749 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBL1P28749 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBL1P28749 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBL1P28749 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBL1P28749 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBL1P28749 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBL1P28749 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBL1P28749 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBL1P28749 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBL1P28749 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBL1P28749 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBL1P28749 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBL1P28749 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RBL1P28749 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RBL1P28749 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RBL1P28749 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RBL1P28749 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RBL1P28749 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RBL1P28749 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RBL1P28749 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RBL1P28749 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBL1P28749 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBL1P28749 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBL1P28749 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBL1P28749 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBL1P28749 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBL1P28749 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBL1P28749 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBL1P28749 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RBL1P28749 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBL1P28749 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBL1P28749 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBL1P28749 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBL1P28749 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBL1P28749 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBL1P28749 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBL1P28749 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBL1P28749 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RBL1P28749 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBL1P28749 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBL1P28749 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RBL1P28749 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBL1P28749 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBL1P28749 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBL1P28749 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBL1P28749 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBL1P28749 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBL1P28749 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBL1P28749 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBL1P28749 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBL1P28749 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBL1P28749 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBL1P28749 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBL1P28749 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RBL1P28749 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBL1P28749 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBL1P28749 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBL1P28749 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBL1P28749 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBL1P28749 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBL1P28749 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBL1P28749 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBL1P28749 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBL1P28749 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBL1P28749 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBL1P28749 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBL1P28749 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBL1P28749 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBL1P28749 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBL1P28749 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBL1P28749 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBL1P28749 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBL1P28749 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBL1P28749 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBL1P28749 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBL1P28749 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RBL1P28749 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBL1P28749 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBL1P28749 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBL1P28749 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBL1P28749 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBL1P28749 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 231.3 ms