Protein–RNA interactions for Protein: P27986

PIK3R1, Phosphatidylinositol 3-kinase regulatory subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R1P27986 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3R1P27986 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3R1P27986 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3R1P27986 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3R1P27986 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3R1P27986 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3R1P27986 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3R1P27986 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3R1P27986 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3R1P27986 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3R1P27986 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3R1P27986 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3R1P27986 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3R1P27986 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3R1P27986 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3R1P27986 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3R1P27986 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3R1P27986 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3R1P27986 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3R1P27986 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3R1P27986 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3R1P27986 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3R1P27986 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3R1P27986 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3R1P27986 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3R1P27986 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3R1P27986 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3R1P27986 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3R1P27986 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3R1P27986 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3R1P27986 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3R1P27986 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3R1P27986 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3R1P27986 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3R1P27986 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3R1P27986 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3R1P27986 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3R1P27986 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3R1P27986 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3R1P27986 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3R1P27986 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3R1P27986 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3R1P27986 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3R1P27986 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3R1P27986 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3R1P27986 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3R1P27986 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3R1P27986 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3R1P27986 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PIK3R1P27986 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PIK3R1P27986 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3R1P27986 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3R1P27986 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3R1P27986 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3R1P27986 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3R1P27986 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3R1P27986 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3R1P27986 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3R1P27986 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3R1P27986 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3R1P27986 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3R1P27986 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3R1P27986 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3R1P27986 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3R1P27986 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3R1P27986 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3R1P27986 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3R1P27986 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3R1P27986 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3R1P27986 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3R1P27986 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3R1P27986 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3R1P27986 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3R1P27986 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3R1P27986 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3R1P27986 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3R1P27986 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3R1P27986 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3R1P27986 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3R1P27986 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3R1P27986 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3R1P27986 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3R1P27986 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3R1P27986 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3R1P27986 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3R1P27986 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3R1P27986 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3R1P27986 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3R1P27986 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3R1P27986 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3R1P27986 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3R1P27986 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3R1P27986 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3R1P27986 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3R1P27986 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3R1P27986 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3R1P27986 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3R1P27986 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3R1P27986 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3R1P27986 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms