Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNE1P24864 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNE1P24864 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNE1P24864 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNE1P24864 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNE1P24864 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNE1P24864 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNE1P24864 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNE1P24864 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNE1P24864 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNE1P24864 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNE1P24864 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNE1P24864 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNE1P24864 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNE1P24864 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNE1P24864 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNE1P24864 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNE1P24864 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNE1P24864 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNE1P24864 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNE1P24864 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNE1P24864 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNE1P24864 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNE1P24864 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNE1P24864 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNE1P24864 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNE1P24864 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNE1P24864 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNE1P24864 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNE1P24864 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNE1P24864 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNE1P24864 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNE1P24864 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNE1P24864 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNE1P24864 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNE1P24864 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNE1P24864 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNE1P24864 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNE1P24864 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNE1P24864 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNE1P24864 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNE1P24864 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCNE1P24864 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCNE1P24864 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCNE1P24864 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCNE1P24864 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCNE1P24864 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCNE1P24864 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCNE1P24864 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCNE1P24864 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCNE1P24864 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCNE1P24864 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCNE1P24864 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCNE1P24864 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCNE1P24864 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCNE1P24864 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCNE1P24864 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNE1P24864 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNE1P24864 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNE1P24864 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNE1P24864 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNE1P24864 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNE1P24864 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNE1P24864 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNE1P24864 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNE1P24864 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNE1P24864 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNE1P24864 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNE1P24864 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCNE1P24864 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCNE1P24864 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCNE1P24864 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCNE1P24864 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCNE1P24864 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCNE1P24864 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCNE1P24864 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCNE1P24864 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCNE1P24864 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCNE1P24864 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCNE1P24864 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCNE1P24864 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCNE1P24864 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCNE1P24864 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCNE1P24864 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCNE1P24864 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCNE1P24864 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCNE1P24864 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCNE1P24864 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCNE1P24864 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCNE1P24864 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCNE1P24864 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCNE1P24864 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCNE1P24864 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCNE1P24864 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCNE1P24864 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCNE1P24864 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCNE1P24864 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCNE1P24864 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCNE1P24864 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCNE1P24864 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms