Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RPS6KB1P23443 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RPS6KB1P23443 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RPS6KB1P23443 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RPS6KB1P23443 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RPS6KB1P23443 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RPS6KB1P23443 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RPS6KB1P23443 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RPS6KB1P23443 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RPS6KB1P23443 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RPS6KB1P23443 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPS6KB1P23443 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
RPS6KB1P23443 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPS6KB1P23443 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPS6KB1P23443 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPS6KB1P23443 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPS6KB1P23443 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPS6KB1P23443 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPS6KB1P23443 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPS6KB1P23443 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPS6KB1P23443 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPS6KB1P23443 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPS6KB1P23443 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPS6KB1P23443 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPS6KB1P23443 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPS6KB1P23443 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPS6KB1P23443 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RPS6KB1P23443 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPS6KB1P23443 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPS6KB1P23443 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPS6KB1P23443 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPS6KB1P23443 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPS6KB1P23443 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPS6KB1P23443 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPS6KB1P23443 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPS6KB1P23443 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPS6KB1P23443 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPS6KB1P23443 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPS6KB1P23443 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPS6KB1P23443 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPS6KB1P23443 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPS6KB1P23443 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPS6KB1P23443 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPS6KB1P23443 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPS6KB1P23443 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPS6KB1P23443 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPS6KB1P23443 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPS6KB1P23443 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPS6KB1P23443 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RPS6KB1P23443 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RPS6KB1P23443 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RPS6KB1P23443 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RPS6KB1P23443 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RPS6KB1P23443 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RPS6KB1P23443 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RPS6KB1P23443 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RPS6KB1P23443 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RPS6KB1P23443 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RPS6KB1P23443 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RPS6KB1P23443 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RPS6KB1P23443 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RPS6KB1P23443 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RPS6KB1P23443 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RPS6KB1P23443 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPS6KB1P23443 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPS6KB1P23443 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPS6KB1P23443 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPS6KB1P23443 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPS6KB1P23443 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPS6KB1P23443 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPS6KB1P23443 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPS6KB1P23443 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPS6KB1P23443 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RPS6KB1P23443 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RPS6KB1P23443 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RPS6KB1P23443 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RPS6KB1P23443 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RPS6KB1P23443 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RPS6KB1P23443 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPS6KB1P23443 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPS6KB1P23443 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPS6KB1P23443 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPS6KB1P23443 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPS6KB1P23443 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPS6KB1P23443 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPS6KB1P23443 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPS6KB1P23443 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPS6KB1P23443 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPS6KB1P23443 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPS6KB1P23443 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RPS6KB1P23443 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPS6KB1P23443 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPS6KB1P23443 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPS6KB1P23443 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPS6KB1P23443 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPS6KB1P23443 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPS6KB1P23443 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPS6KB1P23443 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPS6KB1P23443 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPS6KB1P23443 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms