Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCSHP23434 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCSHP23434 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCSHP23434 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCSHP23434 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCSHP23434 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCSHP23434 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCSHP23434 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCSHP23434 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCSHP23434 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GCSHP23434 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GCSHP23434 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GCSHP23434 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCSHP23434 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCSHP23434 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCSHP23434 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCSHP23434 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCSHP23434 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GCSHP23434 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCSHP23434 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCSHP23434 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCSHP23434 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCSHP23434 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GCSHP23434 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCSHP23434 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCSHP23434 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCSHP23434 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCSHP23434 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCSHP23434 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCSHP23434 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCSHP23434 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCSHP23434 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GCSHP23434 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCSHP23434 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCSHP23434 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCSHP23434 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCSHP23434 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCSHP23434 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCSHP23434 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCSHP23434 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCSHP23434 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCSHP23434 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCSHP23434 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCSHP23434 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCSHP23434 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCSHP23434 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCSHP23434 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCSHP23434 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GCSHP23434 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCSHP23434 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCSHP23434 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCSHP23434 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCSHP23434 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCSHP23434 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCSHP23434 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCSHP23434 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCSHP23434 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCSHP23434 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCSHP23434 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCSHP23434 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCSHP23434 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCSHP23434 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCSHP23434 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCSHP23434 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCSHP23434 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCSHP23434 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCSHP23434 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCSHP23434 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCSHP23434 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCSHP23434 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCSHP23434 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCSHP23434 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCSHP23434 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCSHP23434 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCSHP23434 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCSHP23434 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCSHP23434 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCSHP23434 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCSHP23434 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCSHP23434 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCSHP23434 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCSHP23434 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCSHP23434 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCSHP23434 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCSHP23434 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCSHP23434 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCSHP23434 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCSHP23434 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCSHP23434 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCSHP23434 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCSHP23434 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCSHP23434 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCSHP23434 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GCSHP23434 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCSHP23434 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCSHP23434 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCSHP23434 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCSHP23434 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GCSHP23434 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GCSHP23434 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms