Protein–RNA interactions for Protein: P23193

TCEA1, Transcription elongation factor A protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1P23193 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCEA1P23193 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCEA1P23193 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TCEA1P23193 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TCEA1P23193 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TCEA1P23193 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCEA1P23193 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TCEA1P23193 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCEA1P23193 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCEA1P23193 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCEA1P23193 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCEA1P23193 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCEA1P23193 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TCEA1P23193 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCEA1P23193 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TCEA1P23193 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TCEA1P23193 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCEA1P23193 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TCEA1P23193 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TCEA1P23193 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TCEA1P23193 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TCEA1P23193 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TCEA1P23193 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TCEA1P23193 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TCEA1P23193 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TCEA1P23193 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TCEA1P23193 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TCEA1P23193 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TCEA1P23193 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TCEA1P23193 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.5 ms