Protein–RNA interactions for Protein: P20807

CAPN3, Calpain-3, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3P20807 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN3P20807 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN3P20807 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN3P20807 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN3P20807 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN3P20807 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN3P20807 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN3P20807 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPN3P20807 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN3P20807 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN3P20807 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN3P20807 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN3P20807 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN3P20807 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN3P20807 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN3P20807 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN3P20807 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN3P20807 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN3P20807 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN3P20807 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN3P20807 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN3P20807 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN3P20807 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN3P20807 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN3P20807 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN3P20807 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN3P20807 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN3P20807 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN3P20807 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN3P20807 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN3P20807 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN3P20807 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN3P20807 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN3P20807 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN3P20807 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN3P20807 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN3P20807 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN3P20807 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN3P20807 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN3P20807 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN3P20807 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN3P20807 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN3P20807 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN3P20807 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN3P20807 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN3P20807 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN3P20807 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN3P20807 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN3P20807 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN3P20807 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN3P20807 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN3P20807 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN3P20807 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN3P20807 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN3P20807 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN3P20807 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN3P20807 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN3P20807 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN3P20807 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN3P20807 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN3P20807 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN3P20807 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN3P20807 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN3P20807 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN3P20807 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN3P20807 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN3P20807 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN3P20807 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN3P20807 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN3P20807 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN3P20807 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN3P20807 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN3P20807 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN3P20807 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CAPN3P20807 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CAPN3P20807 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN3P20807 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN3P20807 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN3P20807 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN3P20807 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN3P20807 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN3P20807 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN3P20807 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN3P20807 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN3P20807 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN3P20807 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN3P20807 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN3P20807 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN3P20807 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN3P20807 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN3P20807 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN3P20807 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN3P20807 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN3P20807 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN3P20807 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN3P20807 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN3P20807 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN3P20807 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN3P20807 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN3P20807 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms