Protein–RNA interactions for Protein: P20382

PMCH, Pro-MCH, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHP20382 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMCHP20382 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMCHP20382 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMCHP20382 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMCHP20382 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMCHP20382 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMCHP20382 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMCHP20382 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMCHP20382 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMCHP20382 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PMCHP20382 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMCHP20382 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMCHP20382 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMCHP20382 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PMCHP20382 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PMCHP20382 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PMCHP20382 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PMCHP20382 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PMCHP20382 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PMCHP20382 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PMCHP20382 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PMCHP20382 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PMCHP20382 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PMCHP20382 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PMCHP20382 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PMCHP20382 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PMCHP20382 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PMCHP20382 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PMCHP20382 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PMCHP20382 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PMCHP20382 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PMCHP20382 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PMCHP20382 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PMCHP20382 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PMCHP20382 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PMCHP20382 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PMCHP20382 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PMCHP20382 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PMCHP20382 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PMCHP20382 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PMCHP20382 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PMCHP20382 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PMCHP20382 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PMCHP20382 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PMCHP20382 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PMCHP20382 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PMCHP20382 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PMCHP20382 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PMCHP20382 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PMCHP20382 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PMCHP20382 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PMCHP20382 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PMCHP20382 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PMCHP20382 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PMCHP20382 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PMCHP20382 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PMCHP20382 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PMCHP20382 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PMCHP20382 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PMCHP20382 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PMCHP20382 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PMCHP20382 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PMCHP20382 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PMCHP20382 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PMCHP20382 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PMCHP20382 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PMCHP20382 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PMCHP20382 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PMCHP20382 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PMCHP20382 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PMCHP20382 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PMCHP20382 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PMCHP20382 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PMCHP20382 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PMCHP20382 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PMCHP20382 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PMCHP20382 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PMCHP20382 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PMCHP20382 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PMCHP20382 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PMCHP20382 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PMCHP20382 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMCHP20382 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMCHP20382 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMCHP20382 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMCHP20382 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMCHP20382 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMCHP20382 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMCHP20382 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMCHP20382 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMCHP20382 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMCHP20382 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMCHP20382 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PMCHP20382 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMCHP20382 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMCHP20382 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMCHP20382 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PMCHP20382 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMCHP20382 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMCHP20382 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms