Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB4AP20338 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms