Protein–RNA interactions for Protein: P18848

ATF4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF4P18848 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATF4P18848 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATF4P18848 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATF4P18848 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATF4P18848 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATF4P18848 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATF4P18848 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATF4P18848 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATF4P18848 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATF4P18848 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATF4P18848 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATF4P18848 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATF4P18848 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATF4P18848 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATF4P18848 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATF4P18848 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATF4P18848 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATF4P18848 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATF4P18848 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATF4P18848 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATF4P18848 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATF4P18848 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATF4P18848 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATF4P18848 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATF4P18848 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATF4P18848 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATF4P18848 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATF4P18848 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATF4P18848 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATF4P18848 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATF4P18848 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATF4P18848 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ATF4P18848 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATF4P18848 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATF4P18848 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATF4P18848 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
ATF4P18848 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATF4P18848 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATF4P18848 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATF4P18848 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATF4P18848 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATF4P18848 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATF4P18848 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATF4P18848 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATF4P18848 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATF4P18848 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATF4P18848 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATF4P18848 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATF4P18848 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATF4P18848 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATF4P18848 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ATF4P18848 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATF4P18848 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATF4P18848 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATF4P18848 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATF4P18848 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ATF4P18848 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATF4P18848 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATF4P18848 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATF4P18848 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATF4P18848 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATF4P18848 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATF4P18848 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATF4P18848 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATF4P18848 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATF4P18848 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATF4P18848 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATF4P18848 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATF4P18848 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATF4P18848 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATF4P18848 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATF4P18848 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATF4P18848 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATF4P18848 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATF4P18848 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATF4P18848 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATF4P18848 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATF4P18848 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATF4P18848 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATF4P18848 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATF4P18848 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATF4P18848 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATF4P18848 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ATF4P18848 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATF4P18848 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATF4P18848 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATF4P18848 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATF4P18848 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATF4P18848 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATF4P18848 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATF4P18848 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATF4P18848 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATF4P18848 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATF4P18848 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATF4P18848 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATF4P18848 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATF4P18848 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATF4P18848 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATF4P18848 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATF4P18848 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms