Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DESP17661 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DESP17661 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DESP17661 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DESP17661 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DESP17661 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DESP17661 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DESP17661 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DESP17661 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DESP17661 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DESP17661 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DESP17661 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DESP17661 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DESP17661 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DESP17661 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DESP17661 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DESP17661 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DESP17661 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DESP17661 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DESP17661 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DESP17661 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DESP17661 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DESP17661 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DESP17661 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DESP17661 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DESP17661 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DESP17661 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DESP17661 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DESP17661 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
DESP17661 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DESP17661 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DESP17661 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DESP17661 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DESP17661 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DESP17661 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DESP17661 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DESP17661 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DESP17661 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DESP17661 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DESP17661 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DESP17661 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DESP17661 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DESP17661 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DESP17661 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DESP17661 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DESP17661 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DESP17661 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DESP17661 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DESP17661 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DESP17661 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DESP17661 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DESP17661 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DESP17661 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DESP17661 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DESP17661 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DESP17661 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DESP17661 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DESP17661 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DESP17661 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DESP17661 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DESP17661 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DESP17661 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DESP17661 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DESP17661 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DESP17661 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DESP17661 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DESP17661 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DESP17661 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DESP17661 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DESP17661 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DESP17661 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DESP17661 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DESP17661 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DESP17661 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DESP17661 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DESP17661 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
DESP17661 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DESP17661 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DESP17661 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DESP17661 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DESP17661 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DESP17661 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DESP17661 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DESP17661 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DESP17661 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DESP17661 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DESP17661 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DESP17661 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DESP17661 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DESP17661 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DESP17661 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DESP17661 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DESP17661 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DESP17661 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DESP17661 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DESP17661 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DESP17661 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DESP17661 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DESP17661 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DESP17661 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms