Protein–RNA interactions for Protein: P17480

UBTF, Nucleolar transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTFP17480 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
UBTFP17480 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
UBTFP17480 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
UBTFP17480 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
UBTFP17480 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
UBTFP17480 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
UBTFP17480 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
UBTFP17480 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
UBTFP17480 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
UBTFP17480 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
UBTFP17480 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
UBTFP17480 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
UBTFP17480 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
UBTFP17480 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
UBTFP17480 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
UBTFP17480 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
UBTFP17480 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
UBTFP17480 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC37.38■■■■□ 3.58
UBTFP17480 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
UBTFP17480 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
UBTFP17480 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
UBTFP17480 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
UBTFP17480 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC37.38■■■■□ 3.57
UBTFP17480 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
UBTFP17480 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
UBTFP17480 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
UBTFP17480 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
UBTFP17480 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
UBTFP17480 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
UBTFP17480 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
UBTFP17480 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
UBTFP17480 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
UBTFP17480 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
UBTFP17480 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
UBTFP17480 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
UBTFP17480 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
UBTFP17480 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
UBTFP17480 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
UBTFP17480 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
UBTFP17480 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
UBTFP17480 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
UBTFP17480 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
UBTFP17480 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
UBTFP17480 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
UBTFP17480 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
UBTFP17480 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC37.35■■■■□ 3.57
UBTFP17480 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
UBTFP17480 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
UBTFP17480 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
UBTFP17480 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
UBTFP17480 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
UBTFP17480 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
UBTFP17480 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
UBTFP17480 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
UBTFP17480 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
UBTFP17480 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
UBTFP17480 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
UBTFP17480 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
UBTFP17480 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
UBTFP17480 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
UBTFP17480 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
UBTFP17480 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
UBTFP17480 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
UBTFP17480 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
UBTFP17480 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.56
UBTFP17480 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
UBTFP17480 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
UBTFP17480 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
UBTFP17480 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
UBTFP17480 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
UBTFP17480 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
UBTFP17480 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
UBTFP17480 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC37.31■■■■□ 3.56
UBTFP17480 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
UBTFP17480 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
UBTFP17480 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
UBTFP17480 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
UBTFP17480 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
UBTFP17480 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
UBTFP17480 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
UBTFP17480 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
UBTFP17480 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
UBTFP17480 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
UBTFP17480 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
UBTFP17480 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
UBTFP17480 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
UBTFP17480 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
UBTFP17480 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
UBTFP17480 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
UBTFP17480 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
UBTFP17480 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
UBTFP17480 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
UBTFP17480 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
UBTFP17480 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
UBTFP17480 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
UBTFP17480 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
UBTFP17480 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
UBTFP17480 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
UBTFP17480 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
UBTFP17480 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms