Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
SLC5A1P13866 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC5A1P13866 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC5A1P13866 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC5A1P13866 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC5A1P13866 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC5A1P13866 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC5A1P13866 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC5A1P13866 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC5A1P13866 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC5A1P13866 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC5A1P13866 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC5A1P13866 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC5A1P13866 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC5A1P13866 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC5A1P13866 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC5A1P13866 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC5A1P13866 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC5A1P13866 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC5A1P13866 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC5A1P13866 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC5A1P13866 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC5A1P13866 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC5A1P13866 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC5A1P13866 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC5A1P13866 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC5A1P13866 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC5A1P13866 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC5A1P13866 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC5A1P13866 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC5A1P13866 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC5A1P13866 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC5A1P13866 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC5A1P13866 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC5A1P13866 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC5A1P13866 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC5A1P13866 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC5A1P13866 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC5A1P13866 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC5A1P13866 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC5A1P13866 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC5A1P13866 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC5A1P13866 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC5A1P13866 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC5A1P13866 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC5A1P13866 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SLC5A1P13866 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
SLC5A1P13866 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC5A1P13866 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC5A1P13866 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC5A1P13866 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC5A1P13866 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC5A1P13866 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC5A1P13866 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC5A1P13866 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC5A1P13866 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC5A1P13866 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC5A1P13866 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC5A1P13866 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC5A1P13866 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC5A1P13866 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC5A1P13866 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC5A1P13866 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC5A1P13866 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC5A1P13866 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC5A1P13866 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC5A1P13866 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC5A1P13866 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC5A1P13866 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC5A1P13866 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC5A1P13866 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC5A1P13866 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC5A1P13866 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC5A1P13866 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC5A1P13866 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC5A1P13866 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC5A1P13866 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC5A1P13866 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC5A1P13866 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC5A1P13866 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC5A1P13866 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC5A1P13866 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC5A1P13866 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC5A1P13866 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC5A1P13866 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC5A1P13866 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC5A1P13866 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC5A1P13866 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC5A1P13866 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC5A1P13866 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC5A1P13866 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC5A1P13866 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
SLC5A1P13866 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC5A1P13866 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC5A1P13866 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC5A1P13866 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC5A1P13866 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC5A1P13866 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC5A1P13866 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC5A1P13866 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms