Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH1P12830 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH1P12830 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH1P12830 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH1P12830 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH1P12830 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH1P12830 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH1P12830 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH1P12830 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH1P12830 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH1P12830 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH1P12830 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH1P12830 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH1P12830 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH1P12830 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH1P12830 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH1P12830 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH1P12830 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH1P12830 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH1P12830 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH1P12830 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH1P12830 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDH1P12830 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH1P12830 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH1P12830 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH1P12830 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH1P12830 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH1P12830 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH1P12830 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH1P12830 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH1P12830 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH1P12830 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH1P12830 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH1P12830 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH1P12830 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH1P12830 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH1P12830 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH1P12830 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH1P12830 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH1P12830 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH1P12830 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH1P12830 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH1P12830 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH1P12830 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH1P12830 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH1P12830 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH1P12830 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH1P12830 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH1P12830 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH1P12830 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH1P12830 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH1P12830 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH1P12830 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH1P12830 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH1P12830 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH1P12830 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH1P12830 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH1P12830 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH1P12830 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH1P12830 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH1P12830 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH1P12830 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH1P12830 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH1P12830 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH1P12830 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH1P12830 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH1P12830 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH1P12830 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH1P12830 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH1P12830 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH1P12830 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH1P12830 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH1P12830 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH1P12830 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH1P12830 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH1P12830 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH1P12830 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH1P12830 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH1P12830 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH1P12830 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH1P12830 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH1P12830 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH1P12830 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH1P12830 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH1P12830 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH1P12830 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH1P12830 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH1P12830 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH1P12830 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH1P12830 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH1P12830 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH1P12830 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH1P12830 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH1P12830 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH1P12830 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH1P12830 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH1P12830 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH1P12830 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH1P12830 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH1P12830 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms