Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms