Protein–RNA interactions for Protein: P10745

RBP3, Retinol-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP3P10745 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBP3P10745 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBP3P10745 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBP3P10745 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBP3P10745 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBP3P10745 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBP3P10745 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RBP3P10745 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBP3P10745 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBP3P10745 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBP3P10745 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RBP3P10745 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBP3P10745 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBP3P10745 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBP3P10745 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBP3P10745 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBP3P10745 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBP3P10745 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBP3P10745 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBP3P10745 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBP3P10745 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBP3P10745 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBP3P10745 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBP3P10745 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBP3P10745 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBP3P10745 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBP3P10745 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBP3P10745 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBP3P10745 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RBP3P10745 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBP3P10745 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBP3P10745 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBP3P10745 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBP3P10745 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBP3P10745 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBP3P10745 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBP3P10745 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBP3P10745 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RBP3P10745 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RBP3P10745 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RBP3P10745 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBP3P10745 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBP3P10745 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBP3P10745 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBP3P10745 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBP3P10745 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBP3P10745 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBP3P10745 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RBP3P10745 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBP3P10745 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBP3P10745 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBP3P10745 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RBP3P10745 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBP3P10745 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBP3P10745 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RBP3P10745 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBP3P10745 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBP3P10745 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBP3P10745 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBP3P10745 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RBP3P10745 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBP3P10745 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBP3P10745 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBP3P10745 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBP3P10745 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBP3P10745 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBP3P10745 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBP3P10745 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBP3P10745 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBP3P10745 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBP3P10745 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBP3P10745 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBP3P10745 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBP3P10745 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBP3P10745 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBP3P10745 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBP3P10745 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBP3P10745 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBP3P10745 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBP3P10745 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBP3P10745 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBP3P10745 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBP3P10745 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBP3P10745 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBP3P10745 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBP3P10745 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBP3P10745 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBP3P10745 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBP3P10745 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBP3P10745 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBP3P10745 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBP3P10745 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBP3P10745 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBP3P10745 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBP3P10745 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBP3P10745 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBP3P10745 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBP3P10745 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBP3P10745 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBP3P10745 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms