Protein–RNA interactions for Protein: P0DN78

OPN1MW3, Medium-wave-sensitive opsin 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN1MW3P0DN78 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
OPN1MW3P0DN78 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
OPN1MW3P0DN78 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
OPN1MW3P0DN78 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
OPN1MW3P0DN78 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
OPN1MW3P0DN78 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
OPN1MW3P0DN78 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
OPN1MW3P0DN78 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
OPN1MW3P0DN78 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
OPN1MW3P0DN78 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
OPN1MW3P0DN78 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
OPN1MW3P0DN78 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
OPN1MW3P0DN78 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
OPN1MW3P0DN78 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
OPN1MW3P0DN78 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
OPN1MW3P0DN78 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
OPN1MW3P0DN78 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
OPN1MW3P0DN78 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
OPN1MW3P0DN78 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
OPN1MW3P0DN78 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
OPN1MW3P0DN78 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
OPN1MW3P0DN78 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
OPN1MW3P0DN78 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
OPN1MW3P0DN78 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
OPN1MW3P0DN78 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
OPN1MW3P0DN78 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
OPN1MW3P0DN78 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
OPN1MW3P0DN78 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
OPN1MW3P0DN78 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
OPN1MW3P0DN78 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
OPN1MW3P0DN78 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
OPN1MW3P0DN78 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
OPN1MW3P0DN78 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
OPN1MW3P0DN78 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
OPN1MW3P0DN78 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
OPN1MW3P0DN78 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
OPN1MW3P0DN78 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
OPN1MW3P0DN78 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
OPN1MW3P0DN78 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
OPN1MW3P0DN78 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
OPN1MW3P0DN78 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
OPN1MW3P0DN78 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
OPN1MW3P0DN78 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
OPN1MW3P0DN78 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
OPN1MW3P0DN78 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
OPN1MW3P0DN78 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
OPN1MW3P0DN78 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
OPN1MW3P0DN78 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
OPN1MW3P0DN78 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
OPN1MW3P0DN78 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
OPN1MW3P0DN78 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
OPN1MW3P0DN78 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
OPN1MW3P0DN78 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
OPN1MW3P0DN78 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
OPN1MW3P0DN78 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
OPN1MW3P0DN78 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
OPN1MW3P0DN78 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
OPN1MW3P0DN78 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
OPN1MW3P0DN78 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
OPN1MW3P0DN78 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
OPN1MW3P0DN78 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
OPN1MW3P0DN78 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
OPN1MW3P0DN78 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
OPN1MW3P0DN78 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
OPN1MW3P0DN78 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
OPN1MW3P0DN78 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms