Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMIGD3P0DMS9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMIGD3P0DMS9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMIGD3P0DMS9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMIGD3P0DMS9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMIGD3P0DMS9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMIGD3P0DMS9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMIGD3P0DMS9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMIGD3P0DMS9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMIGD3P0DMS9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMIGD3P0DMS9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMIGD3P0DMS9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMIGD3P0DMS9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMIGD3P0DMS9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMIGD3P0DMS9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMIGD3P0DMS9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMIGD3P0DMS9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMIGD3P0DMS9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMIGD3P0DMS9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMIGD3P0DMS9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMIGD3P0DMS9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMIGD3P0DMS9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMIGD3P0DMS9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMIGD3P0DMS9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMIGD3P0DMS9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMIGD3P0DMS9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMIGD3P0DMS9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMIGD3P0DMS9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMIGD3P0DMS9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMIGD3P0DMS9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TMIGD3P0DMS9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TMIGD3P0DMS9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TMIGD3P0DMS9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TMIGD3P0DMS9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMIGD3P0DMS9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMIGD3P0DMS9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMIGD3P0DMS9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMIGD3P0DMS9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMIGD3P0DMS9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMIGD3P0DMS9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMIGD3P0DMS9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMIGD3P0DMS9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMIGD3P0DMS9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMIGD3P0DMS9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMIGD3P0DMS9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TMIGD3P0DMS9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMIGD3P0DMS9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMIGD3P0DMS9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMIGD3P0DMS9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TMIGD3P0DMS9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMIGD3P0DMS9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMIGD3P0DMS9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMIGD3P0DMS9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMIGD3P0DMS9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMIGD3P0DMS9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMIGD3P0DMS9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMIGD3P0DMS9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMIGD3P0DMS9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMIGD3P0DMS9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMIGD3P0DMS9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMIGD3P0DMS9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMIGD3P0DMS9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMIGD3P0DMS9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMIGD3P0DMS9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMIGD3P0DMS9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMIGD3P0DMS9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMIGD3P0DMS9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMIGD3P0DMS9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMIGD3P0DMS9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMIGD3P0DMS9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMIGD3P0DMS9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMIGD3P0DMS9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMIGD3P0DMS9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMIGD3P0DMS9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMIGD3P0DMS9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMIGD3P0DMS9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
TMIGD3P0DMS9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMIGD3P0DMS9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMIGD3P0DMS9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMIGD3P0DMS9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMIGD3P0DMS9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMIGD3P0DMS9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMIGD3P0DMS9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMIGD3P0DMS9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMIGD3P0DMS9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TMIGD3P0DMS9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMIGD3P0DMS9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMIGD3P0DMS9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMIGD3P0DMS9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms