Protein–RNA interactions for Protein: P0DL12

SMIM17, Small integral membrane protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM17P0DL12 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM17P0DL12 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM17P0DL12 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM17P0DL12 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM17P0DL12 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM17P0DL12 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM17P0DL12 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM17P0DL12 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM17P0DL12 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM17P0DL12 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM17P0DL12 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM17P0DL12 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM17P0DL12 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM17P0DL12 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM17P0DL12 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM17P0DL12 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM17P0DL12 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM17P0DL12 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM17P0DL12 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM17P0DL12 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM17P0DL12 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM17P0DL12 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM17P0DL12 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM17P0DL12 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM17P0DL12 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM17P0DL12 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM17P0DL12 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM17P0DL12 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM17P0DL12 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM17P0DL12 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM17P0DL12 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM17P0DL12 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM17P0DL12 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM17P0DL12 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM17P0DL12 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM17P0DL12 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM17P0DL12 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM17P0DL12 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM17P0DL12 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM17P0DL12 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM17P0DL12 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM17P0DL12 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM17P0DL12 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM17P0DL12 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM17P0DL12 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM17P0DL12 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM17P0DL12 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM17P0DL12 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM17P0DL12 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM17P0DL12 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM17P0DL12 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM17P0DL12 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM17P0DL12 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SMIM17P0DL12 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SMIM17P0DL12 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM17P0DL12 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM17P0DL12 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM17P0DL12 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM17P0DL12 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM17P0DL12 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM17P0DL12 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM17P0DL12 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM17P0DL12 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM17P0DL12 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM17P0DL12 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM17P0DL12 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM17P0DL12 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM17P0DL12 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM17P0DL12 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM17P0DL12 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM17P0DL12 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM17P0DL12 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM17P0DL12 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM17P0DL12 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM17P0DL12 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM17P0DL12 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM17P0DL12 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM17P0DL12 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM17P0DL12 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM17P0DL12 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM17P0DL12 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM17P0DL12 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM17P0DL12 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM17P0DL12 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM17P0DL12 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM17P0DL12 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM17P0DL12 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM17P0DL12 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM17P0DL12 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM17P0DL12 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM17P0DL12 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM17P0DL12 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM17P0DL12 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM17P0DL12 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM17P0DL12 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM17P0DL12 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM17P0DL12 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM17P0DL12 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM17P0DL12 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM17P0DL12 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms