Protein–RNA interactions for Protein: P0C879

Putative uncharacterized protein FLJ43185, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P0C879 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P0C879 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
P0C879 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P0C879 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P0C879 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P0C879 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P0C879 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
P0C879 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P0C879 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P0C879 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P0C879 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P0C879 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P0C879 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P0C879 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P0C879 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P0C879 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P0C879 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P0C879 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P0C879 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P0C879 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P0C879 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
P0C879 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P0C879 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P0C879 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
P0C879 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
P0C879 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P0C879 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P0C879 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P0C879 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P0C879 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P0C879 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P0C879 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P0C879 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P0C879 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P0C879 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P0C879 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P0C879 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P0C879 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P0C879 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P0C879 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P0C879 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P0C879 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
P0C879 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
P0C879 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P0C879 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P0C879 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P0C879 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P0C879 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P0C879 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P0C879 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P0C879 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P0C879 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P0C879 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P0C879 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P0C879 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P0C879 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P0C879 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P0C879 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P0C879 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P0C879 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P0C879 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P0C879 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P0C879 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P0C879 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P0C879 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P0C879 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P0C879 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P0C879 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
P0C879 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
P0C879 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P0C879 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P0C879 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P0C879 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P0C879 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P0C879 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P0C879 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P0C879 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P0C879 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P0C879 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P0C879 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P0C879 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P0C879 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
P0C879 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P0C879 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P0C879 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P0C879 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P0C879 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P0C879 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P0C879 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
P0C879 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P0C879 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P0C879 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
P0C879 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P0C879 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P0C879 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P0C879 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P0C879 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P0C879 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P0C879 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P0C879 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms