Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC175P0C221 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC175P0C221 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC175P0C221 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC175P0C221 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC175P0C221 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC175P0C221 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC175P0C221 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC175P0C221 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC175P0C221 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC175P0C221 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC175P0C221 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC175P0C221 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC175P0C221 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC175P0C221 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC175P0C221 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC175P0C221 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC175P0C221 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC175P0C221 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC175P0C221 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC175P0C221 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC175P0C221 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC175P0C221 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC175P0C221 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC175P0C221 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC175P0C221 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC175P0C221 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC175P0C221 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC175P0C221 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC175P0C221 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC175P0C221 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
CCDC175P0C221 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC175P0C221 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC175P0C221 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC175P0C221 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC175P0C221 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC175P0C221 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC175P0C221 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC175P0C221 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC175P0C221 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC175P0C221 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC175P0C221 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC175P0C221 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC175P0C221 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC175P0C221 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC175P0C221 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC175P0C221 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC175P0C221 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC175P0C221 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC175P0C221 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC175P0C221 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC175P0C221 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC175P0C221 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC175P0C221 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC175P0C221 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC175P0C221 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC175P0C221 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC175P0C221 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC175P0C221 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC175P0C221 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC175P0C221 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC175P0C221 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC175P0C221 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC175P0C221 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC175P0C221 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC175P0C221 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC175P0C221 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC175P0C221 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC175P0C221 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC175P0C221 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC175P0C221 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC175P0C221 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC175P0C221 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC175P0C221 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC175P0C221 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC175P0C221 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC175P0C221 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC175P0C221 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC175P0C221 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC175P0C221 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC175P0C221 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC175P0C221 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC175P0C221 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC175P0C221 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC175P0C221 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC175P0C221 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC175P0C221 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC175P0C221 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC175P0C221 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC175P0C221 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC175P0C221 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC175P0C221 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC175P0C221 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC175P0C221 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC175P0C221 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC175P0C221 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC175P0C221 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC175P0C221 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC175P0C221 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC175P0C221 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms