Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
C4AP0C0L4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
C4AP0C0L4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
C4AP0C0L4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
C4AP0C0L4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
C4AP0C0L4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
C4AP0C0L4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
C4AP0C0L4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
C4AP0C0L4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
C4AP0C0L4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
C4AP0C0L4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
C4AP0C0L4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
C4AP0C0L4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
C4AP0C0L4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
C4AP0C0L4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
C4AP0C0L4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
C4AP0C0L4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
C4AP0C0L4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
C4AP0C0L4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
C4AP0C0L4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
C4AP0C0L4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
C4AP0C0L4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
C4AP0C0L4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
C4AP0C0L4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
C4AP0C0L4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
C4AP0C0L4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
C4AP0C0L4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
C4AP0C0L4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
C4AP0C0L4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
C4AP0C0L4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
C4AP0C0L4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
C4AP0C0L4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
C4AP0C0L4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
C4AP0C0L4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
C4AP0C0L4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
C4AP0C0L4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
C4AP0C0L4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
C4AP0C0L4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
C4AP0C0L4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
C4AP0C0L4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
C4AP0C0L4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
C4AP0C0L4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
C4AP0C0L4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
C4AP0C0L4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
C4AP0C0L4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
C4AP0C0L4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
C4AP0C0L4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
C4AP0C0L4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
C4AP0C0L4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
C4AP0C0L4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
C4AP0C0L4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
C4AP0C0L4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
C4AP0C0L4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
C4AP0C0L4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
C4AP0C0L4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
C4AP0C0L4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
C4AP0C0L4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
C4AP0C0L4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
C4AP0C0L4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
C4AP0C0L4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
C4AP0C0L4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
C4AP0C0L4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
C4AP0C0L4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
C4AP0C0L4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
C4AP0C0L4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
C4AP0C0L4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
C4AP0C0L4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
C4AP0C0L4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
C4AP0C0L4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
C4AP0C0L4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
C4AP0C0L4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
C4AP0C0L4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
C4AP0C0L4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
C4AP0C0L4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
C4AP0C0L4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
C4AP0C0L4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
C4AP0C0L4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
C4AP0C0L4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
C4AP0C0L4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
C4AP0C0L4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
C4AP0C0L4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
C4AP0C0L4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
C4AP0C0L4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
C4AP0C0L4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
C4AP0C0L4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
C4AP0C0L4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
C4AP0C0L4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
C4AP0C0L4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
C4AP0C0L4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
C4AP0C0L4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
C4AP0C0L4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
C4AP0C0L4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
C4AP0C0L4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
C4AP0C0L4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
C4AP0C0L4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
C4AP0C0L4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
C4AP0C0L4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
C4AP0C0L4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
C4AP0C0L4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
C4AP0C0L4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms