Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TPM2P07951 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TPM2P07951 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TPM2P07951 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TPM2P07951 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TPM2P07951 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TPM2P07951 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TPM2P07951 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TPM2P07951 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TPM2P07951 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TPM2P07951 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TPM2P07951 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TPM2P07951 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TPM2P07951 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TPM2P07951 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TPM2P07951 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TPM2P07951 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TPM2P07951 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TPM2P07951 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TPM2P07951 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TPM2P07951 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TPM2P07951 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TPM2P07951 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TPM2P07951 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TPM2P07951 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TPM2P07951 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TPM2P07951 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TPM2P07951 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TPM2P07951 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TPM2P07951 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TPM2P07951 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TPM2P07951 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TPM2P07951 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TPM2P07951 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TPM2P07951 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TPM2P07951 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TPM2P07951 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TPM2P07951 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TPM2P07951 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TPM2P07951 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TPM2P07951 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TPM2P07951 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TPM2P07951 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TPM2P07951 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TPM2P07951 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TPM2P07951 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TPM2P07951 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TPM2P07951 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TPM2P07951 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TPM2P07951 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TPM2P07951 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TPM2P07951 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TPM2P07951 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TPM2P07951 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TPM2P07951 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TPM2P07951 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TPM2P07951 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TPM2P07951 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TPM2P07951 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TPM2P07951 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TPM2P07951 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TPM2P07951 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TPM2P07951 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TPM2P07951 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TPM2P07951 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TPM2P07951 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TPM2P07951 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TPM2P07951 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TPM2P07951 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TPM2P07951 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TPM2P07951 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TPM2P07951 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TPM2P07951 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TPM2P07951 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TPM2P07951 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TPM2P07951 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TPM2P07951 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TPM2P07951 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TPM2P07951 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TPM2P07951 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TPM2P07951 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TPM2P07951 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TPM2P07951 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TPM2P07951 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TPM2P07951 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TPM2P07951 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TPM2P07951 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TPM2P07951 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TPM2P07951 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TPM2P07951 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TPM2P07951 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TPM2P07951 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TPM2P07951 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TPM2P07951 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TPM2P07951 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TPM2P07951 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TPM2P07951 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TPM2P07951 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TPM2P07951 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TPM2P07951 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms